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Premix Ex Taq (Probe qPCR)

 
應(yīng)用LightCycler/LightCycler 480 System的操作方法
請(qǐng)按照LightCycler/LightCycler 480(Roche Diagnostics公司)的使用說(shuō)明書要求進(jìn)行實(shí)驗(yàn)操作
 
1. 按下列組份配制PCR反應(yīng)液(反應(yīng)液配制請(qǐng)?jiān)诒线M(jìn)行)。
試劑 使用量 終濃度
 Premix Ex Taq(Probe qPCR)(2X) 10.0 μl   1X  
 PCR Forward Primer(10 μM) 0.4 μl   0.2 μM*1  
 PCR Reverse Primer(10 μM) 0.4 μl   0.2 μM*1  
 Probe 0.8 μl   *2  
 DNA模板 2.0 μl   *3  
 dH2O(滅菌水) 6.4 μl    
 Total 20.0 μl    
*1 通常引物終濃度為0.2 μM可以得到較好結(jié)果。反應(yīng)性能較差時(shí),可以在0.1-1.0 μM范圍內(nèi)調(diào)整引物濃度。
*2 使用的探針濃度,與使用的Real Time PCR擴(kuò)增儀、探針?lè)N類、熒光標(biāo)記物質(zhì)種類有關(guān),實(shí)際使用時(shí)請(qǐng)參照儀器說(shuō)明書,或各熒光探針的具體使用要求進(jìn)行。
*3 模板添加量因模板溶液中存在的靶基因的拷貝數(shù)不同而不同,進(jìn)行梯度稀釋研討適當(dāng)?shù)哪0逄砑恿俊D0錎NA添加量最好在100 ng以下。以RT-PCR反應(yīng)的cDNA (RT反應(yīng)液) 為模板時(shí),添加量不要超過(guò)PCR反應(yīng)液總體積的10%。
 
2. 進(jìn)行Real Time PCR反應(yīng)。
PCR反應(yīng)用毛細(xì)管請(qǐng)用離心機(jī)輕輕離心后放入LightCycler中進(jìn)行Real Time PCR反應(yīng)。建議采用下列圖表顯示的兩步法PCR反應(yīng)程序,如果該程序得不到良好的實(shí)驗(yàn)結(jié)果時(shí),再進(jìn)行PCR條件的優(yōu)化。有關(guān)PCR的具體反應(yīng)條件請(qǐng)參照「PCR反應(yīng)條件概述」。
<LightCycler>
兩步法PCR擴(kuò)增標(biāo)準(zhǔn)程序:
Stage 1:預(yù)變性
95℃ 30秒 20℃/秒
1 Cycle
Stage 2:PCR反應(yīng)
95℃ 5秒 20℃/秒
60℃ 20秒 20℃/秒
40 Cycles
 
 
 
<LightCycler 480 System>
兩步法PCR擴(kuò)增標(biāo)準(zhǔn)程序:
  Denature
95℃ 30秒 (Ramp rate: 4.4℃/sec)
1 Cycle
  PCR
Analysis Mode: Quantification
95℃ 5秒 (Ramp rate: 4.4℃/sec)
60℃ 30秒 (Ramp rate: 2.2℃/sec, Acquisition Mode : Single)
Cooling Cycle
  Cooling
50℃ 30秒 (Ramp rate: 2.2℃/sec)
1 Cycle
 
 
◆特別提示:
本制品中使用的TaKaRa Ex Taq HS是利用抗Taq抗體的Hot Start用DNA聚合酶,與其他公司的化學(xué)修飾型Hot Start用DNA聚合酶相比,不需要PCR反應(yīng)前的95℃、5-15分鐘的酶的活性化反應(yīng)。如果高溫處理時(shí)間過(guò)長(zhǎng),會(huì)使酶的活性下降,其PCR的擴(kuò)增效率、定量準(zhǔn)確度等都會(huì)受到影響。如果在PCR反應(yīng)前進(jìn)行模板的預(yù)變性,通常設(shè)定為95℃、30秒。
 
3. 實(shí)驗(yàn)結(jié)果分析。
反應(yīng)結(jié)束后確認(rèn)Real Time PCR的擴(kuò)增曲線,進(jìn)行PCR定量時(shí)制作標(biāo)準(zhǔn)曲線等。分析方法參見(jiàn)儀器的操作手冊(cè)。