TB Green® Premix Ex Taq™ II (Tli RNaseH Plus) |
實(shí)驗(yàn)條件的選擇 |
如果按照推薦的兩步法條件進(jìn)行反應(yīng),反應(yīng)性能不好時(shí),請(qǐng)按照下面的方法進(jìn)行引物和PCR反應(yīng)條件的研討。另外,根據(jù)反應(yīng)情況選擇特異性不同的Perfect Real Time系列試劑(Code No. RR420Q/A/B, RR430 S/A/B, RR091A/B),可提高PCR反應(yīng)性能。 |
實(shí)驗(yàn)條件選擇時(shí),請(qǐng)從反應(yīng)特異性與擴(kuò)增效率兩方面進(jìn)行綜合考慮。要求能同時(shí)滿(mǎn)足這兩個(gè)條件的反應(yīng)體系,并可以在較大濃度范圍內(nèi)進(jìn)行很好的定量。 |
○ 反應(yīng)特異性高的實(shí)驗(yàn)體系應(yīng)具備以下條件: |
· No Template Control 時(shí)不產(chǎn)生引物二聚體等非特異性擴(kuò)增。 · 不產(chǎn)生目的片段以外的擴(kuò)增。 |
○ 擴(kuò)增效率高的實(shí)驗(yàn)體系應(yīng)具備以下條件: |
· 擴(kuò)增產(chǎn)物起峰更早(Ct值?。?。 · PCR擴(kuò)增效率高(接近理論值100%)。 |
1. Primer濃度與反應(yīng)性能間的關(guān)系如下: |
降低Primer濃度有助于提高特異性;提高Primer濃度有助于提高擴(kuò)增效率。圖示如下: |
2. PCR條件與反應(yīng)性能間的關(guān)系如下: |
① 要提高反應(yīng)特異性,可以提高退火溫度。 |
② 要提高擴(kuò)增效率,可以增加延伸時(shí)間或變?yōu)? Step PCR反應(yīng)。 |
③ 預(yù)變性。 預(yù)變性條件通常設(shè)定為95℃ 30 sec,使用此條件對(duì)于難變性的環(huán)狀質(zhì)粒DNA和基因組DNA模板基本上也能夠很好的變性。如果對(duì)難變性的模板想改變變性條件,可以延長(zhǎng)至1~2分鐘。但是時(shí)間過(guò)長(zhǎng)酶容易失活,不推薦使用2分鐘以上的變性條件。 |
3. 各種試劑與反應(yīng)性能間的關(guān)系如下: |
Takara Bio提供幾種不同的TB Green嵌合法real-time PCR試劑,這些試劑的反應(yīng)特異性以及擴(kuò)增效率間有以下關(guān)系。TB Green Premix Ex Taq (Tli RNaseH Plus)(Code No. RR420Q/A/B)和TB Green Fast qPCR Mix (Code No. RR430A/B)是擴(kuò)增效率與反應(yīng)特異性綜合性較好、通用性高的試劑,但是,如果想提高反應(yīng)特異性,使用TB Green Premix DimerEraser™ (Perfect Real Time)(Code No. RR091A/B)和TB Green Premix Ex Taq II (Tli RNaseH Plus) (Code No. RR820Q/A/B)則更有效。 |