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TaKaRa Taq

TaKaRa TaqE.coli基因組DNA的污染檢測(cè)
 
    目前,市場(chǎng)上銷(xiāo)售的Taq DNA Polymerase幾乎均是經(jīng)過(guò)克隆轉(zhuǎn)化到E.coli中進(jìn)行表達(dá)后,分離提取得到的,那么就可能存在E.coli基因組DNA導(dǎo)致的內(nèi)源性污染。實(shí)驗(yàn)中使用E.coli來(lái)源的DNA混入量最低的高品質(zhì)的Taq DNA Polymerase尤為重要。
    下面是為了檢測(cè)TaKaRa Taq和其他公司的Taq DNA Polymerase(標(biāo)準(zhǔn)級(jí)別)的E.coli基因組DNA污染,針對(duì)ori區(qū)域進(jìn)行了巢式PCR擴(kuò)增例。
    從圖2結(jié)果來(lái)看,TaKaRa Taq中沒(méi)有E.coli基因組DNA的擴(kuò)增片段,但其他公司的Taq DNA Polymerase(標(biāo)準(zhǔn)級(jí)別)有ori區(qū)域(143 bp)的擴(kuò)增片段。通過(guò)泳道9的擴(kuò)增結(jié)果也可以證明Taq DNA Polymerase(標(biāo)準(zhǔn)級(jí)別)中有E.coli的基因組DNA的擴(kuò)增。
    從以下結(jié)果看出,TaKaRa Taq中的E.coli基因組DNA量很少,在巢式PCR擴(kuò)增檢測(cè)界限1-10 fg以下,證明TaKaRa Taq的品質(zhì)高于其他公司標(biāo)準(zhǔn)級(jí)別的Taq DNA Polymerase。
 
   圖1:E. coli基因組的Ori區(qū)域和引物設(shè)計(jì)
 
 
   圖2:2nd PCR反應(yīng)的結(jié)果
 
Lane       Template量
Lane 1 :       0 negative test
Lane 2 :       0
Lane 3 :       0
Lane 4 :       0
Lane 5 :       0
Lane 6 :       1 pg positive control
Lane 7 :       100 fg
Lane 8 :       10 fg
Lane 9 :       1 fg
 
擴(kuò)增區(qū)域:  E. coli. ori region
目的片段大?。?/span>  2nd PCR 143bp
M:  pHY Marker(Code No. 3404A/B)各8 μl電泳
     泳道6-9作為陽(yáng)性對(duì)照,在1st PCR時(shí)分別加入1 pg、100 fg、10 fg 、1 fg E. coli JM109基因組DNA后進(jìn)行了巢式PCR。