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PrimeSTAR HS® DNA Polymerase |
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存在PCR反應(yīng)阻害物(SDS、腐殖酸)時(shí)與其他酶的活性比較 |
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以懷疑有SDS及腐殖酸污染的DNA為模板進(jìn)行PCR反應(yīng)時(shí),使用PrimeSTAR HS DNA Polymerase可有效進(jìn)行PCR擴(kuò)增。 |
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(1)存在SDS時(shí)的酶活性 |
有時(shí)以含SDS的檢測(cè)樣品為模板進(jìn)行PCR反應(yīng)。因PrimeSTAR HS DNA Polymerase不易受到SDS對(duì)PCR反應(yīng)的阻害,所以含SDS的檢測(cè)樣品也可放心使用PrimeSTAR HS DNA Polymerase。 |
使用PrimeSTAR HS DNA Polymerase和Taq DNA Polymerase(rTaq),在PCR反應(yīng)液中加入SDS后對(duì)SDS對(duì)PCR反應(yīng)的阻害進(jìn)行了研討。反應(yīng)體系以E. coli 基因組DNA為模板,擴(kuò)增1.5 kb DNA片段。 |
使用rTaq,反應(yīng)體系中的SDS終濃度為0.005%時(shí),完全阻害PCR反應(yīng)。而使用PrimeSTAR HS DNA Polymerase,即使反應(yīng)體系中的SDS終濃度為0.01%時(shí)也可擴(kuò)增。 |
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(A)使用rTaq (B)使用PrimeSTAR HS DNA Polymerase |
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圖 存在SDS時(shí)的PCR反應(yīng) |
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Lane M: |
λ-Hind III digest |
Lane 1: |
未添加SDS和模板 |
Lane 2: |
SDS終濃度為0.01% |
Lane 3: |
SDS終濃度為0.005% |
Lane 4: |
SDS終濃度為0.002% |
Lane 5: |
SDS終濃度為0.001% |
Lane 6: |
未添加SDS |
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(2)存在腐殖酸時(shí)的酶活性 |
近來(lái)研究經(jīng)常使用從土壤等環(huán)境樣品直接提取的DNA進(jìn)行分析。使用這種方法提取的DNA作為檢測(cè)樣品進(jìn)行PCR反應(yīng)時(shí),必須注意要防止腐殖酸的污染。腐殖酸在土壤中分為2部分,一部分溶于堿,一部分不溶于酸,除土壤外海底堆積物等含有的紅褐色或黑褐色的有機(jī)物。即使微量的腐殖酸也對(duì)PCP反應(yīng)有很強(qiáng)阻害作用。而使用PrimeSTAR HS DNA Polymerase即使存在腐殖酸也能發(fā)揮酶的活性,可檢測(cè)的檢測(cè)樣品范圍。將粗提的腐殖酸液(土壤提取液)*稀釋后加入到PCR反應(yīng)液中,使用PrimeSTAR HS DNA Polymerase和rTaq對(duì)腐殖酸對(duì)PCR反應(yīng)的阻害進(jìn)行了研討。反應(yīng)體系以E. coli 基因組DNA為模板,擴(kuò)增1.5 kb DNA片段。 |
使用rTaq,即使添加0.01μl腐殖酸時(shí)也有很強(qiáng)的阻害作用。而使用PrimeSTAR HS DNA Polymerase,添加0.01 μl腐殖酸時(shí)與未添加腐殖酸的PCR同樣可以進(jìn)行擴(kuò)增。因此,對(duì)于含SDS和腐殖酸污染的DNA模板,PrimeSTAR HS DNA Polymerase也能有效擴(kuò)增。 |
*:腐殖酸不是標(biāo)準(zhǔn)的試劑,是從土壤中用堿溶出后,經(jīng)酸溶液沉淀,再用堿溶液溶解獲得。原液A280=10、A700=0。 |
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(A)使用rTaq |
(B)使用PrimeSTAR HS DNA Polymerase |
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圖 存在腐殖酸時(shí)的PCR反應(yīng) |
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Lane M: |
λ-Hind III digest |
Lane 1: |
未添加腐殖酸和模板 |
Lane 2: |
腐殖酸溶液添加量0.1 μl |
Lane 3: |
腐殖酸溶液添加量0.01 μl |
Lane 4: |
腐殖酸溶液添加量0.001 μl |
Lane 5: |
腐殖酸溶液添加量0.0001 μl |
Lane 6: |
未添加腐殖酸 |
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