|
|
RNAiso Plus |
|
|
雞軟骨及骨組織中的RNA提取 |
|
|
[使用試劑] |
RNAiso Plus(Code No. 9108) |
High-Salt Solution for Precipitation (Plant)(Code No. 9193) |
|
[檢測(cè)樣品] |
雞軟骨組織 200 mg |
雞骨組織 200 mg |
|
[方法] |
1. RNA提取 |
|
· |
將200mg雞軟骨組織和骨組織移至乳缽中,邊加液氮邊研磨至粉末。 |
|
· |
液氮揮發(fā)后,加入4ml RNAiso Plus,再次進(jìn)行勻漿后按照RNAiso Plus的操作流程進(jìn)行了RNA提取。但是在異丙醇沉淀時(shí),加入0.25倍RNAiso Plus體積量的High-Salt Solution for Precipitation (Plant)混合,再加入0.25倍RNAiso Plus體積量的異丙醇,混合后再按照RNAiso Plus的操作流程回收了total RNA。最后溶解于30 μl RNase-free water。 |
|
· |
與沒有添加High-Salt Solution for Precipitation (Plant)的相同檢測(cè)樣品按照RNAiso Plus的操作流程回收的total RNA進(jìn)行了比較。 |
|
2. RT-PCR |
|
· |
使用1提取的RNA對(duì)β-actin進(jìn)行了RT-PCR。使用擴(kuò)增mRNA來源和基因組DNA來源DNA時(shí)擴(kuò)增片段大小不同的引物,對(duì)混入的基因組DNA進(jìn)行了確認(rèn)。 |
|
|
[結(jié)果] |
1. 提取RNA的電泳結(jié)果 |
<軟骨組織> |
|
Lane: |
提取方法 |
1、2: |
RNAiso Plus |
3、4: |
RNAiso Plus+High-Salt Solution
for Precipitation (Plant) |
|
|
<骨組織> |
|
Lane: |
提取方法 |
1、2: |
RNAiso Plus |
3、4: |
RNAiso Plus+High-Salt Solution
for Precipitation (Plant) |
|
Total RNA 5 μl Apply |
|
1% Agarose |
|
M: DL2,000 DNA Marker |
|
|
2. 提取RNA的收量和純度 |
<軟骨組織> |
檢測(cè)樣品No.
|
提取方法 |
提取量
(μl) |
A260 |
A280 |
A260/A230 |
A260/A280 |
RNA量*1
(μg/100 mg組織)
|
1 |
RNAiso Plus |
30 |
66.36 |
44.60 |
1.06 |
1.49 |
79.63*2 |
2 |
RNAiso Plus |
30 |
85.77 |
51.31 |
0.99 |
1.67 |
102.92*2 |
3 |
RNAiso Plus+High-Salt |
30 |
4.56 |
2.43 |
2.43 |
1.88 |
5.47 |
4 |
RNAiso Plus+High-Salt |
30 |
5.66 |
2.90 |
1.66 |
1.95 |
6.79 |
|
|
<骨組織> |
檢測(cè)樣品
No. |
提取方法 |
提取量
(μl) |
A260 |
A280 |
A260/A230 |
A260/A280 |
RNA量*1
(μg/100 mg組織) |
1 |
RNAiso Plus |
30 |
83.00 |
49.15 |
0.99 |
1.67 |
99.61*2 |
2 |
RNAiso Plus |
30 |
80.46 |
57.75 |
0.91 |
1.39 |
96.55*2 |
3 |
RNAiso Plus+High-Salt |
30 |
4.56 |
2.55 |
1.75 |
1.97 |
6.01 |
4 |
RNAiso Plus+High-Salt |
30 |
5.66 |
3.28 |
2.08 |
1.98 |
7.79 |
|
|
*1 RNA量:利用A260計(jì)算出的值 |
*2 僅使用RNAiso Plus提取的檢測(cè)樣品中因含有大量的多糖等雜質(zhì), 認(rèn)為A260的測(cè)定值沒有反映出準(zhǔn)確的RNA量。 |
|
3. 提取的RNA進(jìn)行了RT-PCR反應(yīng) |
|
RNA Sample: |
各500 ng |
RT Primer: |
Oligo dT Primer |
反轉(zhuǎn)錄酶: |
Reverse Transcriptase M-MLV (RNase H-)(Code No. 2641) |
PCR酶: |
TaKaRa LA Taq(Code No.RR002A) |
反轉(zhuǎn)錄反應(yīng): |
10 μl |
PCR反應(yīng)體系: |
50 μl(使用2 μl反轉(zhuǎn)錄反應(yīng)液) |
Target: |
β-actin |
mRNA來源的擴(kuò)增片段大?。?/span> |
561bp |
genome DNA來源的擴(kuò)增片段大?。?/span> |
561bp |
PCR 條件: |
98℃ 30 sec. |
|
30 cycles |
|
55℃ 10 sec. |
|
72℃ 1 min. |
|
|
<骨組織> |
|
Lane: |
提取方法 |
1: |
RNAiso Plus |
2: |
RNAiso Plus [RTase(-)] |
3: |
RNAiso Plus+High-Salt |
4: |
RNAiso Plus+High-Salt [RTase(-)] |
|
PCR反應(yīng)液 10μl上樣 |
|
3% Agarose |
|
M:100 bp DNA Ladder |
|
|
|
|
[總結(jié)] |
|
· |
使用RNAiso Plus從骨和軟骨中提取RNA過程中,在異丙醇沉淀沈時(shí)加入High-Salt Solution for Precipitation (Plant)后回收RNA、可制備A260/A280比值高于1.8的高純度total RNA。軟骨來源RNA進(jìn)行凝膠電泳時(shí)還可確認(rèn)到核糖體RNA片段。 |
|
· |
從RT-PCR的結(jié)果可以看出,從軟骨中提取RNA時(shí),僅使用RNAiso Plus 提取的RNA有微弱的擴(kuò)增產(chǎn)物,而使用High-Salt Solution for Precipitation (Plant)提取的RNA,軟骨來源和骨來源均可獲得清晰的擴(kuò)增產(chǎn)物。此外,二者在RTase(-)的擴(kuò)增結(jié)果中沒有確認(rèn)到基因組來源的擴(kuò)增產(chǎn)物。 |
|
· |
一般從骨和軟骨組織中很難提取RNA,但使用RNAiso Plus提取RNA時(shí)與High-Salt Solution for Precipitation (Plant)并用可獲得如本實(shí)驗(yàn)所示的高純度RNA。 |
|
|