|
|
PrimeSTAR® GXL DNA Polymerase |
|
|
最適參數(shù)的設定 |
|
為了發(fā)揮PrimeSTAR GXL DNA Polymerase的最大性能、獲得良好的PCR擴增結果,有必要按照最適參數(shù)進行設定。 |
(1)Primer的設計 |
引物最好利用專業(yè)引物設計軟件進行設計(選擇最適的引物序列),如OLIGO™ Primer Analysis Software (Molecular Biology Insights, Inc.)。 |
【擴增DNA片段≦10 kb時】 |
一般引物長度為20-25 mer即可獲得良好的擴增,當引物的Tm值(使用操作流程中的公式計算)在55℃以上,或引物長度在25 mer以上,可進一步提高PCR反應的成功率。使用PrimeSTAR GXL DNA Polymerase時,避免使用含次黃嘌呤核苷堿基(Inosine)的引物。 |
【擴增DNA片段>10 kb時】 |
建議引物Tm值在65℃以上,引物長度為25-35 mer,設計引物時3’端的GC含量不要過高。 |
【靶基因GC rich時】 |
建議引物的Tm值在60℃以上。 |
NOTE:使用PrimeSTAR GXL DNA Polymerase時,避免使用含次黃嘌呤核苷堿基(Inosine)的引物。 |
|
(2)dNTP與Mg2+ |
由于dNTP具有螯合作用,dNTP濃度過高就會使實際參與反應的Mg2+濃度下降。 |
PrimeSTAR GXL DNA Polymerase配帶的5×PrimeSTAR GXL Buffer中含有的Mg2+終濃度為1 mM、dNTP終濃度為200 μM each,是獲得良好擴增結果的最適反應體系。盡量避免變更dNTP在反應體系中的濃度。 |
使用PrimeSTAR GXL DNA Polymerase時,不能用dUTP代替dTTP(使反應性能明顯下降)。 |
|
(3)模板 |
建議使用的模板量如下(50 μl反應體系): |
|
(普通擴增時) |
(擴增大片段DNA時) |
人基因組DNA |
5 ng~500 ng |
100 ng~500 ng |
大腸桿菌基因組DNA |
100 pg~200 ng |
10ng~200 ng |
λDNA |
10 pg~10 ng |
1 ng~10 ng |
cDNA |
25 ng~750 ng |
250 ng~750 ng |
|
|
* 亞硫酸氫鹽處理后的含有尿嘧啶的DNA為模板時不能使用本制品。
|
|
|