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PrimeSTAR® GXL DNA Polymerase

最適參數(shù)的設定
 
   為了發(fā)揮PrimeSTAR GXL DNA Polymerase的最大性能、獲得良好的PCR擴增結果,有必要按照最適參數(shù)進行設定。
(1)Primer的設計
   引物最好利用專業(yè)引物設計軟件進行設計(選擇最適的引物序列),如OLIGO Primer Analysis Software (Molecular Biology Insights, Inc.)。
【擴增DNA片段≦10 kb時】
   一般引物長度為20-25 mer即可獲得良好的擴增,當引物的Tm值(使用操作流程中的公式計算)在55℃以上,或引物長度在25 mer以上,可進一步提高PCR反應的成功率。使用PrimeSTAR GXL DNA Polymerase時,避免使用含次黃嘌呤核苷堿基(Inosine)的引物。
【擴增DNA片段>10 kb時】
   建議引物Tm值在65℃以上,引物長度為25-35 mer,設計引物時3’端的GC含量不要過高。
【靶基因GC rich時】
   建議引物的Tm值在60℃以上。
   NOTE:使用PrimeSTAR GXL DNA Polymerase時,避免使用含次黃嘌呤核苷堿基(Inosine)的引物。
 
(2)dNTP與Mg2+
   由于dNTP具有螯合作用,dNTP濃度過高就會使實際參與反應的Mg2+濃度下降。
   PrimeSTAR GXL DNA Polymerase配帶的5×PrimeSTAR GXL Buffer中含有的Mg2+終濃度為1 mM、dNTP終濃度為200 μM each,是獲得良好擴增結果的最適反應體系。盡量避免變更dNTP在反應體系中的濃度。
   使用PrimeSTAR GXL DNA Polymerase時,不能用dUTP代替dTTP(使反應性能明顯下降)。
 
(3)模板
   建議使用的模板量如下(50 μl反應體系):
  (普通擴增時) (擴增大片段DNA時)
 人基因組DNA 5 ng~500 ng 100 ng~500 ng
 大腸桿菌基因組DNA 100 pg~200 ng 10ng~200 ng
 λDNA 10 pg~10 ng 1 ng~10 ng
 cDNA 25 ng~750 ng 250 ng~750 ng
   * 亞硫酸氫鹽處理后的含有尿嘧啶的DNA為模板時不能使用本制品。