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使用各公司PCR酶擴(kuò)增亞硫酸氫鹽處理后的DNA |
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【方法】 |
以亞硫酸氫鹽處理后的HeLa基因組DNA為模板,使用TaKaRa EpiTaq HS及其他公司的PCR酶進(jìn)行擴(kuò)增。
(處理后的HeLa基因組DNA 100 ng/50 μl反應(yīng)體系) 反應(yīng)按以下條件進(jìn)行。 |
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亞硫酸氫鹽處理:MethylEasy Xceed Rapid DNA Bisulphite Modification Kit(Code No. ME002) |
目的基因:CDKN2A、BRCA1 gene 上游的CpG 島區(qū)域 |
擴(kuò)增大?。?44 bp (CDKN2A)、1,017 bp (BRCA1) |
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<反應(yīng)液組成> |
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使用量 |
終濃度 |
亞硫酸氫鹽處理HeLa 基因組DNA(50 ng/μl) |
2 μl |
100 ng/50 μl |
10 × EpiTaq PCR Buffer (Mg2+ free) |
5 μl |
1× |
25 mM MgCl2 |
5 μl |
2.5 mM |
dNTP Mixture(各2.5 mM) |
6 μl |
0.3 mM |
Sense Primer(20 μM) |
1 μl |
0.4 μM |
Antisense Primer(20 μM) |
1 μl |
0.4 μM |
TaKaRa EpiTaq HS(5 U/μl) |
0.25 μl |
1.25 U/50 μl |
滅菌水 |
up to 50 μl |
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<PCR條件> |
98℃ 10 sec. |
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40 cycles |
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55℃ 30 sec. |
72℃ [30 sec.(144 bp)or 1 min.(1,017 bp)] |
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(TaKaRa EpiTaq HS以外的其他試劑按各公司反應(yīng)條件進(jìn)行反應(yīng)) |
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【結(jié)果】 |
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