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使用各公司PCR酶擴(kuò)增亞硫酸氫鹽處理后的DNA

 
【方法】
以亞硫酸氫鹽處理后的HeLa基因組DNA為模板,使用TaKaRa EpiTaq HS及其他公司的PCR酶進(jìn)行擴(kuò)增。
(處理后的HeLa基因組DNA 100 ng/50 μl反應(yīng)體系) 反應(yīng)按以下條件進(jìn)行。
 
亞硫酸氫鹽處理:MethylEasy Xceed Rapid DNA Bisulphite Modification Kit(Code No. ME002)
目的基因:CDKN2A、BRCA1 gene 上游的CpG 島區(qū)域
擴(kuò)增大?。?44 bp (CDKN2A)、1,017 bp (BRCA1)
 
<反應(yīng)液組成>
 
  使用量 終濃度
  亞硫酸氫鹽處理HeLa 基因組DNA(50 ng/μl) 2 μl 100 ng/50 μl
  10 × EpiTaq PCR Buffer (Mg2+ free) 5 μl
  25 mM MgCl2 5 μl 2.5 mM
  dNTP Mixture(各2.5 mM) 6 μl 0.3 mM
  Sense Primer(20 μM) 1 μl 0.4 μM
  Antisense Primer(20 μM) 1 μl 0.4 μM
  TaKaRa EpiTaq HS(5 U/μl) 0.25 μl 1.25 U/50 μl
  滅菌水 up to 50 μl  
 
 
<PCR條件>
98℃ 10 sec.   40 cycles  
55℃ 30 sec.  
72℃ [30 sec.(144 bp)or 1 min.(1,017 bp)]  
 
(TaKaRa EpiTaq HS以外的其他試劑按各公司反應(yīng)條件進(jìn)行反應(yīng))
 
 
【結(jié)果】