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PrimeScript™ RT-PCR Kit的實驗操作(Code No.RR014A) |
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A. Template RNA變性及反轉(zhuǎn)錄反應(yīng) |
A-1 配制下列反應(yīng)混合液 |
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試劑 |
使用量 |
dNTP Mixture(10 mM each) |
1 μl |
Oligo dT Primer(2.5 μM)
or Random 6 mers(20 μM)
or Specific Primer(2 μM)*1 |
1 μl |
Template RNA*2
or Positive Control RNA |
[4×105 copies] |
RNase Free dH2O |
up to 10 μl |
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*1 合成cDNA的引物可結(jié)合實際情況從Oligo dT Primer、Random 6 mers、Specific Primer中任選一種(對于Control RNA,使用R-1 Primer)。 |
*2 Template RNA最多可加至8 μl,當(dāng)使用Total RNA時,最多可加至5 μg (推薦使用量:100 pg~1 μg)。 |
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A-2 在PCR儀上進行變性、退火反應(yīng) |
65℃ 5 min |
4℃ |
NOTE:變性、退火操作有利于模板RNA的變性以及反轉(zhuǎn)錄引物和模板的特異性退火,可提高反轉(zhuǎn)錄反應(yīng)效率。 |
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A-3 在上述反應(yīng)管中配制下列反轉(zhuǎn)錄反應(yīng)液 |
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試劑 |
使用量 |
上述變性、退火后反應(yīng)液 |
10 μl |
5×PrimeScript Buffer |
4 μl |
RNase Inhibitor(40 U/μl) |
0.5 μl |
PrimeScript RTase(for 2 Step) |
0.5 μl |
RNase Free dH2O |
5 μl |
Total Volume |
20 μl |
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A-4 在PCR儀上按下列條件進行反轉(zhuǎn)錄反應(yīng) |
(30℃ 10 min.)*3 |
42℃(~50℃) 15~30 min. |
95℃ 5 min.*4 |
4℃ |
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*3 反轉(zhuǎn)錄反應(yīng)引物為Random 6 mers時,此操作可使Random 6 mers在42℃ (~50℃) 和模板RNA充分退火、延伸,增加反轉(zhuǎn)錄效率。 |
*4 進行長片段DNA擴增時,為了保證1st strand cDNA完整,請進行70℃、15 min 的失活反應(yīng)。。 |
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NOTE:PrimeScript RTase對具有復(fù)雜二級結(jié)構(gòu)的模板同樣具有良好的延伸性能,通??稍?2℃下進行反應(yīng)。使用特異性下游引物進行反轉(zhuǎn)錄時,有時會因錯配而產(chǎn)生非特異性擴增。此時可將溫度升到50℃,可能會減少非特異性擴增。 |
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B. PCR反應(yīng) |
B-1 按下列組成配制PCR反應(yīng)液 |
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試劑 |
使用量 |
Final concentration |
10×PCR Buffer Ⅱ |
5 μl |
1× |
dNTP Mixture(10 mM each) |
2 μl |
400 μM |
Upstream Primer(20 μM)*5(Sense) |
0.5 μl |
0.2 μM |
Downstream Primer(20 μM)*6(Anti-sense) |
0.5 μl |
0.2 μM |
TaKaRa Ex Taq HS(5 U/μl) |
0.5 μl |
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上述的反轉(zhuǎn)錄反應(yīng)液 |
≤5 μl |
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滅菌水 |
up to 50 μl |
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*5 Positive Control RNA使用F-1 Primer。 |
*6 Positive Control RNA使用R-1 Primer。 |
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B-2 按照下面的反應(yīng)條件進行反應(yīng) |
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一般反應(yīng)條件 |
(A)三步法PCR的反應(yīng)條件: |
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30 cycles |
(B)兩步法PCR的反應(yīng)條件: |
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30 cycles |
94℃ 30 sec. |
98℃ 10 sec. |
55~65℃ 30 sec. |
68℃ 1 min./kb |
72℃ 1 min./kb |
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Positive Control RNA*7的反應(yīng)條件 |
94℃ 30 sec. |
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30 cycles |
60℃ 30 sec. |
72℃ 1 min |
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*7 在進行PCR擴增時使用Control Primer F-1和R-1引物,都可以得到462 bp的PCR擴增產(chǎn)物。 |
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