PrimeScript™High Fidelity RT-PCR Kit的操作方法 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
A. 模板RNA的變性及反轉錄反應 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
A-1. 按下述所示制備反應液 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
試劑 | 使用量 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
dNTP Mixture(10 mM each) | 1 μl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Oligo dT Primer (2.5 μM) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
or Random 6 mers(20 μM) | 1 μl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
or Specific Primer (2 μM)*1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Template RNA*2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
or Positive Control RNA | [4×105 copies] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNase Free dH2O | up to 10 μl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
*1 合成cDNA的引物可結合實際情況從Oligo dT Primer、Random 6 mers、Specific Primer中任選一種。 *2 Template RNA最多可加至8 μl,當使用Total RNA時,最多可加至3 μg(推薦使用量:100 ng~1 μg)。 |
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A-2. 制備后的反應管置于Thermal Cycler中,按下述程序進行變性,退火。 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
65℃ 5 min. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
4℃ | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
<重要>通過上述變性?退火操作,反轉錄引物能夠特異性的與模板RNA退火,提高反轉錄效率。 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
A-3. 變性·退火后的反應液添加以下試劑。 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
試劑 | 使用量 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
A-2 的變性·退火后的反應液 | 10 μl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
5×PrimeScript Buffer | 4 μl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNase Inhibitor (40 U/μl) | 0.5 μl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PrimeScript RTase | 0.5 μl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNase Free dH2O | 5 μl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
20 μl | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
A-4. 反應管置于Thermal Cycler中,按照下述程序進行反轉錄反應。 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
(30℃ 10 min.)*3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
42℃ (~ 50)℃ 15~30 min. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
95℃ 5 min.*4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
4℃ | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
*3 反轉錄反應使用Random 6 mers時,進行此操作可使Random 6 mers與模板RNA在42℃(~50℃)充分退火延伸,從而提高反轉錄效率。 *4 進行長片段DNA 擴增時,為了避免破損1st cDNA 鏈,可70℃反應15 min進行失活操作。 |
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<重要> 對于高級結構,PrimeScript RTase具有很強的延伸性能,通常反應在42℃進行。使用特異性的下游PCR引物進行反轉錄時,會出現(xiàn)由于引物錯配導致的非特異性擴增產物。此時,可以通過將反應溫度設置為50℃進行改善。 |
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B. PCR反應 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
B-1. 按下述所示制備反應液 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
試劑 | 使用量 | 終濃度 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PrimeSTAR Max Premix(2×) | 25 μl | 1× | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
上游Primer(20 μM)*5(sense) | 0.5 μl | 0.2 μM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
下游Primer(20 μM)*6(antisense) | 0.5 μl | 0.2 μM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
A-4 中的反轉錄反應液 | ≤5 μl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
滅菌水 | up to 50 μl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
*5 Positive Control RNA時,使用F-1 Primer *6 Positive Control RNA時,使用R-1 Primer |
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B-2. 制備后的反應管放于Thermal Cycler中,以適宜條件進行PCR。 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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