反轉(zhuǎn)錄反應(yīng)中引物的選擇、RNA樣品的制備、操作注意事項 |
1. 關(guān)于反轉(zhuǎn)錄引物的選擇 |
用于反轉(zhuǎn)錄的引物可視實驗具體情況選擇Random 9 mers、Oligo dT Primer或特異性下游引物。對于不具有Hairpin構(gòu)造的短鏈mRNA,3種引物中的任何一種都可以使用,但一般應(yīng)按以下方法進行選擇。 |
Oligo dT Primer: 適用于具有Poly(A)+ Tail的RNA。本Primer設(shè)計巧妙,反轉(zhuǎn)錄效率高。(注意:原核生物的RNA、真核生物的rRNA及tRNA以及某些種類的真核生物的mRNA不具有Poly (A)+)。 |
Random 9 mers: 適用于長的或具有Hairpin構(gòu)造的RNA。包括rRNA、mRNA、tRNA等在內(nèi)的所有RNA的反轉(zhuǎn)錄反應(yīng)都可使用本引物。 |
特異性下游PCR Primer(PCR時的下游引物): 因其必須與模板序列互補,所以只適用于Target序列已知的情況。 |
2. RNA樣品制備 |
本試劑盒是把RNA合成cDNA,然后再對此cDNA進行擴增的試劑盒。RNA的純度會影響cDNA的合成量,而制備RNA的關(guān)鍵是要抑制細胞中的RNA分解酶和防止所用器具及試劑中的RNA分解酶的污染。因此,在實驗中必須采取以下措施:戴一次性干凈手套;使用RNA操作專用實驗臺;在操作過程中避免講話等等。通過以上辦法可以防止實驗者的汗液、唾液中的RNA分解酶的污染。 |
【使用器具】 |
盡量使用一次性塑料器具。若使用玻璃器具,應(yīng)在使用前按下列方法進行處理。 |
(1) 用0.1% DEPC(焦碳酸二乙酯)水溶液在37℃下處理12小時。 (2) 然后在120℃下高壓滅菌30分鐘以除去殘留的DEPC。 |
RNA實驗用的器具和儀器建議專門使用,不要用于其它實驗。 |
【試劑配制】 |
用于RNA實驗的試劑,包括蒸餾水,須使用干熱滅菌(180℃,60 min.)或用上述方法進行DEPC水處理滅菌后的玻璃容器盛裝(也可使用RNA實驗用的一次性塑料容器),使用的滅菌水須用0.1%的DEPC處理后進行高溫高壓滅菌。 |
RNA實驗用的試劑和滅菌水都應(yīng)專用,避免混用后交叉污染。 |
【制備方法】 |
使用簡單的RNA純化方法即可獲得滿足于RT-PCR反應(yīng)的RNA(只需少量的RNA便可進行RT-PCR反應(yīng))。但為了保證實驗的成功率,建議使用GTC法(異硫氰酸胍法)制備的高純度RNA。 使用NucleoSpin RNA(Code No. 740955.10)或RNAiso Plus(Code No. 9108/9109),可從組織、細胞中快速提取高純度的Total RNA。 使用本試劑盒進行RT-PCR反應(yīng)時,每次反應(yīng)所需的最適Total RNA量約為500 ng。 |
【RNA樣品量】 |
使用本試劑盒進行RT-PCR反應(yīng)時,每次反應(yīng)所需的最適Total RNA量約為500 ng。 |
3. 使用注意事項 |
以下為使用本試劑盒時的注意事項,使用前一定認真閱讀。 |
1). 當(dāng)同時需要進行數(shù)次反轉(zhuǎn)錄反應(yīng)或PCR反應(yīng)時,應(yīng)先配制各種試劑的混合液(Master Mix;其中包括RNase Free dH2O、Buffer、dNTP Mixture、MgSO4等),然后再分裝到每個反應(yīng)管中。這樣,可使所取的試劑體積更準(zhǔn)確,減少試劑損失,避免重復(fù)分取同一試劑。同時也可以減少實驗操作或?qū)嶒炛g產(chǎn)生的誤差。 2) 使用BcaBEST Polymerase、RNase Inhibitor、Bca-Optimized Taq等酶類時,應(yīng)輕輕混勻,避免起泡;分取之前要小心地離心收集到反應(yīng)管底部;由于酶保存液中含有50%的甘油,粘度高,分取時應(yīng)慢慢吸取。 3) 酶制品應(yīng)在實驗前才從-20℃中取出,使用后也應(yīng)立即放回-20℃中保存。 4) 為了防止Positive Control RNA分解,應(yīng)盡量避免反復(fù)凍融。有條件的實驗室最好保存于 -70℃~-80℃。 5) 分裝試劑時務(wù)必使用新的槍頭(Tip),以防止樣品間污染。 |