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In-Fusion Cloning:連接酶的高效率高準(zhǔn)確度替代方法

 
【數(shù)據(jù)提供】
研究1: Ti-yu Lin, Graduate Student, Univ. of Wisconsin-Madison
研究2: Madhusudan Rajendran, Research Assistant, Univ. of Wisconsin-Madison
 
【實(shí)驗(yàn)簡介】
在下面這些研究中,In-Fusion Cloning被用于傳統(tǒng)連接酶方法不成功的克隆實(shí)驗(yàn)。兩個(gè)實(shí)驗(yàn)都使用了pET載體,這是一種常用的體內(nèi)重組蛋白質(zhì)表達(dá)系統(tǒng)。當(dāng)使用連接酶時(shí),兩位研究人員都無法克隆獲得想要的片段:Ti-yu Lin的目的片段為~1 kb并高GC含量(67%GC),Madhusudan Rajendran使用編碼novobiocin抗性的大插入片段(gyrase B; 2.4 kb)。
 
使用In-Fusion克隆,兩位科學(xué)家都能夠有效地將其片段克隆到限制酶消化的線性化載體中,通過菌落PCR篩選確定陽性克隆。雖然每個(gè)項(xiàng)目的具體細(xì)節(jié)都有不同的挑戰(zhàn),但結(jié)果是相同的:In-Fusion技術(shù)在第一次嘗試時(shí)就產(chǎn)生了陽性克隆,并且手動(dòng)操作時(shí)間很短。
 
【實(shí)驗(yàn)結(jié)果】
PCR擴(kuò)增目的片段顯示了兩個(gè)正確大小的單一條帶(圖1),將這些片段克隆到它們各自的目的載體中(圖2), 隨后通過菌落PCR分析。對于研究1,由In-Fusion克隆方法產(chǎn)生的10個(gè)菌落中的8個(gè)是陽性克隆。對于研究2,32個(gè)篩選的菌落中有21個(gè)是陽性克隆。在這兩種情況下,研究人員都能夠成功地將目的基因進(jìn)行克隆。
 
圖1. 目的片段的PCR擴(kuò)增。使用CloneAmp HiFi PCR Premix從基因組DNA模板擴(kuò)增目的基因。 PCR引物將In-Fusion Cloning重疊序列引入到PCR產(chǎn)物的5'和3'末端。(圖A)研究1,插入片段~1 kb插入。(圖B)研究2,插入片段2.4 kb。
 
【用戶感言】
“這個(gè)試劑盒的效果超出我們的預(yù)期。PCR產(chǎn)物純化試劑盒回收了高濃度DNA(~90 ng /μl)。 此外,我使用常規(guī)連接方法沒能獲得任何陽性克隆,而使用In-Fusion克隆,我能夠獲得21個(gè)陽性克隆。謝謝你們的幫助!”
-Madhusudan Rajendran, UNIV. OF WISCONSIN-MADISON
 
圖2. 菌落篩選。菌落PCR用于確定陽性克隆。(圖A)在研究1中,檢測的10個(gè)菌落中有8個(gè)顯示~1.3 kb的條帶,為陽性克隆。(圖B)在研究2中,檢測的32個(gè)菌落中的21個(gè)顯示~2.6 kb的條帶,為陽性克隆。
 
【結(jié)論】
先前基于連接酶方法的克隆工作未能產(chǎn)生令人滿意的結(jié)果,但使用In-Fusion HD Cloning Plus后,兩個(gè)獨(dú)立的項(xiàng)目都得到了陽性克隆。在每次嘗試中,兩位研究人員都能夠成功地將其具有挑戰(zhàn)性的插入片段克隆到pET表達(dá)載體中。
 
 
 
詳細(xì)實(shí)驗(yàn)方法和步驟請見:
https://www.takarabio.com/learning-centers/cloning/in-fusion-cloning-tech-notes/a-successful-alternative-to-ligation-cloning