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添加分子標(biāo)簽的RNA-Seq分析試劑盒上市啦！

有時(shí)候，標(biāo)簽是個(gè)貶義詞，害怕被貼標(biāo)簽，害怕被定義，被束縛。
但有時(shí)候，標(biāo)簽又是個(gè)褒義詞。比如在構(gòu)建測序文庫時(shí)，通過添加特別的“分子標(biāo)簽”（Unique Molecular Identifiers, UMIs），可以更好的校正來自PCR錯(cuò)誤、重復(fù)序列以及序列錯(cuò)誤的讀取。

（您也可以抽大約五分鐘時(shí)間，讀一讀我們之前推送UDI?UMI?快來圍觀寶藏主播找答案吧的文章，相信可以幫您詳盡地了解UMI和UDI。）

目前，各路科研工作人員面臨的NGS檢測靈敏度與特異性的瓶頸，可能是由樣品準(zhǔn)備、擴(kuò)增偏差及測序錯(cuò)誤所引起的。而向Ilumina文庫添加特有的分子標(biāo)簽UMI能有效改善這一問題。出于文庫制備與測序質(zhì)量直接相關(guān)的考慮，Takara特別優(yōu)化推出了接頭上帶UMIs及整合UDIs的全新產(chǎn)品SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 - Pico Input Mammalian！

它的前一代產(chǎn)品SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v2 - Pico Input Mammalian仰仗自身過硬的產(chǎn)品性能，在腫瘤研究、病原微生物檢測、液體活檢等領(lǐng)域的轉(zhuǎn)錄組分析大受好評。

那么，SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 - Pico Input Mammalian有何過人之處？

■ 來自UMIs的“鼎力相助”

非常重要的一點(diǎn)，添加分子標(biāo)簽（UMIs）：在文庫制備過程中，通過逆轉(zhuǎn)錄步驟（在PCR擴(kuò)增之前）添加8nt UMI，可以靈敏地識(shí)別PCR重復(fù)片段并校正PCR擴(kuò)增錯(cuò)誤，從而進(jìn)行正確的樣本數(shù)據(jù)回溯，提供更可靠的RNA-Seq分析！

■ UDIs技術(shù)的“加持”

該試劑盒包含SMARTer RNA Unique Dual Index Kit - 24U (Code No. 634451)，能更正確拆析采用圖案化流動(dòng)槽技術(shù)（Patterned flow cell）測序平臺(tái)（如NovaSeq^™ system）的下機(jī)數(shù)據(jù)，同時(shí)也支持更多樣本同時(shí)測序。

■ 直擊痛點(diǎn)，無需擔(dān)心RNA質(zhì)量差

與前一代一樣，它同樣無懼RNA降解，能分析質(zhì)量較差的FFPE、cfRNA、外泌體以及病原微生物來源的樣本。并且無需核糖體RNA前處理，更小的手動(dòng)操作誤差，可直接以人、大/小鼠來源的250 pg-10 ng的總RNA或者10-1000個(gè)細(xì)胞樣本起始，快速高效的構(gòu)建鏈特異性文庫，科研人員再不用擔(dān)心珍貴樣本損失了！

■ Takara案例分析

從FFPE樣本中分離純化核酸進(jìn)行NGS分析研究逐漸成為重要手段，但由于FFPE樣本容易發(fā)生核酸的降解和損傷，所以從有限且珍貴的FFPE樣本中獲得完整且正確的信息進(jìn)行建庫測序非常具有挑戰(zhàn)性！但有了Takara FFPE樣本分析利器，事情正在發(fā)生變化！

Takara科學(xué)家采用以0.5、1、5和10 ng人肺FFPE組織提取的總RNA起始，采用SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 - Pico Input Mammalian制備RNA-Seq文庫（均做兩個(gè)重復(fù)），并使用NextSeq 500進(jìn)行測序。

結(jié)果顯示，同一樣品不同起始量的情況下，測序數(shù)據(jù)非常相似，并且技術(shù)重復(fù)之間具有高度一致性。而TPM≥1的基因檢測數(shù)也均超過18,000。特別值得注意的是，比對到核糖體rRNA和線粒體基因組的比率相對較低。

所以對有限且珍貴的樣本的測序分析具有較大難度時(shí)，選它--SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 - Pico Input Mammalian，沒錯(cuò)！

■ 產(chǎn)品列表

Code No.	產(chǎn)品名稱	包裝量
634485	SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 - Pico Input Mammalian	24 Rxns
634486	SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 - Pico Input Mammalian	48 Rxns
634487	SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 - Pico Input Mammalian	96 Rxns
634488	SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 - Pico Input Mammalian	192 Rxns

頁面更新：2020-12-02 14:18:55

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