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Takara qPCR引物/探針設(shè)計(jì)工具數(shù)據(jù)庫(kù)升級(jí)啦!

 

Takara qPCR引物/探針設(shè)計(jì)工具于2023年11月1日在Takara中國(guó)官網(wǎng)發(fā)布,供購(gòu)買Takara qPCR重點(diǎn)產(chǎn)品的您免費(fèi)設(shè)計(jì)引物/探針,歡迎使用。
 
該系統(tǒng)設(shè)計(jì)的引物具有以下特點(diǎn):
1. 序列經(jīng)過特別設(shè)計(jì),引物二聚體形成率低。
2. 跨內(nèi)含子設(shè)計(jì),減少基因組DNA的擴(kuò)增。
3. 引物中不包括已知的SNP(對(duì)于人類基因,引物中不包括置信度較高的SNP)。
4. 通過同源檢索確認(rèn)了特異性。
5. 可以根據(jù)實(shí)驗(yàn)?zāi)康倪x擇設(shè)計(jì)區(qū)域,例如在全域設(shè)計(jì)或在3'側(cè)設(shè)計(jì)。
 
  Takara qPCR引物/探針設(shè)計(jì)工具數(shù)據(jù)庫(kù)升級(jí)
 
① Perfect Real Time支持系統(tǒng)for probe法已升級(jí)!(2024年1月25日)
我們根據(jù)2023年11月的目標(biāo)物種(人、小鼠、大鼠)的基因序列信息為基礎(chǔ)設(shè)計(jì),并更新了數(shù)據(jù)庫(kù)。
版本升級(jí)前后的設(shè)計(jì)基因數(shù)和設(shè)計(jì)轉(zhuǎn)錄本數(shù)如下。
 物種  assembly  設(shè)計(jì)基因數(shù)  設(shè)計(jì)轉(zhuǎn)錄本數(shù)
 升級(jí)  升級(jí)
 前  后  前  后
 人  hg38  23,592  24,866  61,603  67,899
 小鼠  mm39  23,434  23,789  42,050  49,842
 大鼠  rn7  17,349  17,852  19,374  20,460
 
② Perfect Real Time支持系統(tǒng)for染料法已升級(jí)!(2024年1月25日)
我們根據(jù)2023年11月的目標(biāo)物種(人、小鼠、大鼠、牛、狗、雞)的基因序列信息為基礎(chǔ)設(shè)計(jì),并更新了數(shù)據(jù)庫(kù)。
這次沒有進(jìn)行擬南芥、水稻的版本升級(jí)。
版本升級(jí)前后的設(shè)計(jì)基因數(shù)和設(shè)計(jì)轉(zhuǎn)錄本數(shù)如下。
 物種  assembly  設(shè)計(jì)基因數(shù)  設(shè)計(jì)轉(zhuǎn)錄本數(shù)
 升級(jí)  升級(jí)
 前  后  前  后
 人  hg38  23,894  25,215  62,111  68,495
 小鼠  mm39  23,629  23,993  42,277  50,125
 大鼠  rn7  17,417  17,922  19,448  20,536
 牛  bosTau9  20,438  20,973  62,637  63,683
 狗  canFam6  20,747  21,296  125,579  185,289
 雞  galGal6  17,949  17,968  124,823  124,793
 
注:
版本升級(jí)前:基于2022年5月的序列信息設(shè)計(jì)
版本升級(jí)后:基于2023年11月的序列信息設(shè)計(jì)

請(qǐng)充分利用這個(gè)設(shè)計(jì)工具。
 
 
  引物探針設(shè)計(jì)流程如下
 
* 填寫正確的qPCR試劑信息,可以免費(fèi)設(shè)計(jì)一次;每個(gè)qPCR試劑信息僅限使用一次。
 
  qPCR引物探針設(shè)計(jì)工具簡(jiǎn)介
Takara qPCR引物探針設(shè)計(jì)工具是基于Takara Bio總部的Perfect Real Time Support System (PRTSS);
★ Perfect Real Time Support System (PRTSS) 用于實(shí)時(shí)熒光定量PCR的引物/探針設(shè)計(jì)。
★ 使用Takara特別的引物設(shè)計(jì)技術(shù),結(jié)合不斷更新的NCBI遺傳信息數(shù)據(jù)庫(kù),搭配生物信息學(xué)優(yōu)化的引物設(shè)計(jì),幫助研究人員完成復(fù)雜的引物設(shè)計(jì)工作。
★ PRTSS設(shè)計(jì)的引物和探針,針對(duì)Takara的qPCR試劑和緩沖體系進(jìn)行了優(yōu)化,與Takara試劑配合使用,可以獲得更好的qPCR結(jié)果。
★ 凡是訂購(gòu)Takara qPCR相關(guān)重點(diǎn)產(chǎn)品(具體Code No.詳見下表),即可免費(fèi)使用PRTSS進(jìn)行引物/探針設(shè)計(jì)。
注:使用Takara qPCR引物探針設(shè)計(jì)工具時(shí),需要SEQ信息,SEQ信息通過掃描產(chǎn)品外包裝獲得,請(qǐng)保留以下列表中產(chǎn)品外包裝。
Code No. 制品名稱 可以使用的Lot
RR430A TB Green® Fast qPCR Mix 2024年3月到期以后的Lot
RR390L Premix Ex Taq™ (Probe qPCR), Bulk
RR82LR TB Green® Premix Ex Taq II (Tli RNaseH Plus), ROX plus
RR036A PrimeScript™ RT Master Mix (Perfect Real Time) 2024年4月到期以后的Lot
RR037A PrimeScript™ RT reagent Kit (Perfect Real Time)
RR42LR TB Green® Premix Ex Taq (Tli RNaseH Plus), ROX plus
RR047A PrimeScript™ RT reagent Kit with gDNA Eraser (Perfect Real Time) 2024年9月到期以后的Lot
RR820A TB Green® Premix Ex Taq™ II (Tli RNaseH Plus)
RR420A TB Green® Premix Ex Taq™ (Tli RNaseH Plus)
RR820L TB Green® Premix Ex Taq™ II (Tli RNaseH Plus), Bulk
RR420L TB Green® Premix Ex Taq™ (Tli RNaseH Plus), Bulk
RR391A Probe qPCR Mix 2025年1月到期以后的Lot
RR390A Premix Ex Taq™ (Probe qPCR)
CN830A TB Green® Premix Ex Taq™ II FAST qPCR
RR092A PrimeScript™ FAST RT reagent Kit with gDNA Eraser
RR393A Probe qPCR Mix MultiPlus 全部可用
 
 

頁(yè)面更新:2024-02-05 09:22:51