不同純化級(jí)別制品的選擇指導(dǎo) |
DNA合成時(shí),每個(gè)堿基依次偶聯(lián)到增長(zhǎng)中的鏈上。每一個(gè)循環(huán)都會(huì)有一個(gè)小比例的Oligos鏈不能被延伸,合成產(chǎn)物是一個(gè)由目的序列與失敗序列組成的混合物。隨著Oligos長(zhǎng)度的增加,失敗序列的相對(duì)比例在增大。 Oligos從支持體上切下后,需要首先脫去堿基上的保護(hù)基,之后進(jìn)行精制將失敗序列從全長(zhǎng)序列中分離出去。需要的Oligos純度水平取決于失敗序列的存在是否會(huì)對(duì)實(shí)驗(yàn)造成影響。有些應(yīng)用只允許目的序列存在,而對(duì)于有些應(yīng)用,較短序列存在(n-1,n-2…)不會(huì)影響實(shí)驗(yàn)結(jié)果。 |
■ 本公司提供以下級(jí)別的制品 |
◇ OPC純化: OPC純化利用裝有C18樹(shù)脂的Cartridge小柱純化制品,分離的基礎(chǔ)是依據(jù)全長(zhǎng)序列(帶有DMT基團(tuán))與失敗序列(沒(méi)有DMT基團(tuán))疏水性的差別。本純化方法提供的純度水平,通常為85-95%。 對(duì)于大多數(shù)分辨率要求比較高的應(yīng)用,OPC純化提供了必要純度水平的制品。純化后的制品可用于測(cè)序、克隆、PCR、突變等。 ◇ PAGE純化: PAGE純化分離依據(jù)的是分子量與電荷。在電場(chǎng)作用下,不同長(zhǎng)度序列遷移的速率不同。 將Oligo DNA/RNA粗制品上樣到聚丙烯酰胺凝膠板上,采用適宜的凝膠濃度電泳,回收目的帶進(jìn)行精制。 目的序列較短時(shí),N-1失敗序列會(huì)被有效去除;序列更長(zhǎng)(>60 mer)時(shí),PAGE是非常好的純化方式。由于具有很高的分辨率,PAGE純化提供的制品純度接近于離子交換HPLC。 ◇ 反相HPLC純化: 依據(jù)的原理同OPC純化,根據(jù)被分離物質(zhì)疏水性的不同,將不同長(zhǎng)度的、或?qū)в行揎椈鶊F(tuán)與不帶修飾基團(tuán)的Oligos分離開(kāi)來(lái)。 反相HPLC在純化帶有疏水性修飾基團(tuán)的目的序列與不帶修飾基團(tuán)的失敗序列時(shí),是非常有效的純化方法;但分離N-1失敗序列的能力較差,遠(yuǎn)不如離子交換HPLC的分辨能力。 ◇ 離子交換HPLC純化: 根據(jù)分子所帶負(fù)電荷的多少,利用梯度洗脫,將目的序列與失敗序列分離開(kāi)來(lái)。離子交換HPLC的分辨率非常高,能分離掉N-1失敗序列,得到高純度的產(chǎn)品(≥95%,序列特殊時(shí)純度會(huì)有所降低)。 ◇ HPLC+PAGE純化: Oligos經(jīng)過(guò)HPLC和PAGE雙重純化,利用兩種不同的分離原理純化過(guò)的Oligos具有非常高的純度。 |
此外要補(bǔ)充說(shuō)明的是,以上所述各級(jí)別制品的純度會(huì)隨著Oligo長(zhǎng)度及序列組成的不同而發(fā)生改變,Oligo長(zhǎng)度增加、序列特殊(形成高級(jí)結(jié)構(gòu)等),制品的純度會(huì)有所降低。 |
如果訂購(gòu)的Oligos序列特殊,本公司會(huì)根據(jù)實(shí)際情況選擇最優(yōu)的純化方式,PAGE、HPLC、或雙次純化,此時(shí)本公司將不再另行通知。 |
頁(yè)面更新:2019-08-29 16:29:36