■ 產(chǎn)品簡(jiǎn)介 |
蛋白質(zhì)質(zhì)譜分析前的樣品消化步驟,通常需要4個(gè)小時(shí)甚至過夜,如果使用Capturem™ Trypsin 或 Capturem™ Pepsin,可在室溫下快速,高效和完全的消化蛋白質(zhì),從而使蛋白質(zhì)組學(xué)分析流程更加連貫。這兩款產(chǎn)品是一次性小型離心柱的形式,應(yīng)用新型膜技術(shù),膜上固定有胰蛋白酶(Trypsin)或胃蛋白酶(Pepsin),在短短幾分鐘內(nèi)即可高效、完全地酶解蛋白質(zhì)樣品,與傳統(tǒng)的溶液法過夜處理相比,時(shí)間更短、效率更高、重復(fù)性更好、胰蛋白酶自溶片段更少,避免發(fā)生過度消化。 |
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■ 快速、簡(jiǎn)單的操作流程 |
Capturem™ Trypsin 和 Capturem™ Pepsin包含小型離心柱和活化buffer,操作流程簡(jiǎn)單、快速,只需要加入200 μl活化buffer離心1 min,然后加入蛋白質(zhì)樣品再離心1 min,即可洗脫獲得可用于下游分析的肽段。 |
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■ 產(chǎn)品特點(diǎn) |
·操作快速,2 min-3 min內(nèi)即可酶解蛋白質(zhì)樣品,無需過夜處理
·比溶液法效率更高,酶解更徹底
·樣品中自溶片段更少,蛋白質(zhì)非特異性修飾幾率更低
·可以使整個(gè)蛋白質(zhì)組學(xué)分析流程更加連貫,實(shí)現(xiàn)更有效的肽和蛋白質(zhì)的質(zhì)譜鑒定
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■ 應(yīng)用 |
·蛋白質(zhì)鑒定
·蛋白質(zhì)組學(xué)分析
·質(zhì)譜樣品制備
·抗體鑒定
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■ 實(shí)驗(yàn)例 |
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使用Capturem™ Trypsin對(duì)BT474全細(xì)胞裂解液進(jìn)行酶解消化并做蛋白質(zhì)組學(xué)分析。通過RP-HPLC將裂解液分成19個(gè)獨(dú)立的組分(圖A),然后再使用Capturem™ Trypsin對(duì)每個(gè)組分單獨(dú)酶解,并使用LC/MS-MS分析,每個(gè)組分中帶有2個(gè)或以上的特異性肽段的蛋白質(zhì)總數(shù)被鑒定并繪制出,如B圖所示。 |
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使用Capturem™ Trypsin可以實(shí)現(xiàn)快速完全的Apomyoglobin(Apo)酶解。上圖為使用RP-HPLC分析Capturem™ Trypsin和常規(guī)溶液法酶解蛋白質(zhì)的結(jié)果,圖A為未酶解的完整蛋白質(zhì),圖B為溶液法室溫酶解16 h的蛋白質(zhì),圖C為使用Capturem™ Trypsin酶解1 min的蛋白質(zhì),結(jié)果顯示使用Capturem™ Trypsin酶解的非常徹底。 |
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使用Capturem™ Trypsin可以酶解緊密折疊的蛋白質(zhì)Myoglobin (Myo)。使用RP-HPLC對(duì)Capturem™ Trypsin和常規(guī)溶液法酶解的產(chǎn)物進(jìn)行分析,圖A為未酶解的完整蛋白質(zhì),圖B為溶液法室溫酶解16 h的蛋白質(zhì),圖C為使用Capturem™ Trypsin酶解1 min的蛋白質(zhì),結(jié)果顯示使用Capturem™ Trypsin可以快速有效地酶解緊密折疊的蛋白質(zhì)。 |
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Capturem™ Pepsin的操作流程。在酶消化之前,抗體樣品被變性和還原。使用附帶的活化buffer初次活化柱子后,將還原處理后的抗體樣品溶液(50-800 μl)加入離心柱中,離心1分鐘。 在這個(gè)過程中,柱上發(fā)生胃蛋白酶消化,隨后再一次離心洗脫即可獲得肽片段,加入NaOH中和洗脫的肽片段,即可用于下游分析。 |
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使用Capturem™ Pepsin消化不同的小鼠抗體同種型。小鼠的IgG1, IgG2a, IgG2b, 和 IgG3各取
100 μg,使用TCEP和醋酸于75℃處理15 min進(jìn)行變性操作,然后用5%甲酸buffer稀釋。使用Capturem™ Pepsin對(duì)稀釋的樣品進(jìn)行消化,通過SDS-PAGE對(duì)消化和未消化的樣品(各取4 μg)進(jìn)行檢測(cè),如上圖所示。 |
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不同批次的Capturem™ Pepsin消化產(chǎn)物HPLC圖譜比較。使用5%的甲酸稀釋50 μg的Apo,選擇3個(gè)不同批次的Capturem™ Pepsin對(duì)其進(jìn)行消化,HPLC結(jié)果顯示三組消化產(chǎn)物具有相同的片段,說明Capturem™ Pepsin具有良好的重復(fù)性。 |
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Capturem™ Pepsin與pepsin溶液法消化結(jié)果比較。對(duì)50 μg 的anti-HER2單克隆抗體使用3種方法進(jìn)行消化,分別是Capturem™ Pepsin,pepsin溶液法孵育4小時(shí),pepsin溶液法孵育過夜。然后進(jìn)行質(zhì)譜分析。由上圖可以看出,使用溶液法的消化產(chǎn)物峰左移并且總體峰的數(shù)量較多,說明產(chǎn)生了過度消化,而使用Capturem™ Pepsin則沒有這個(gè)問題。 |
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