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■ 制品內(nèi)容 (50 次量) |
PCR Premix* |
500 μl × 3 支 |
PCR primers: |
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Forward primer (20 pmol/μl) |
30 μl × 1 支 |
Reverse primer1 (20 pmol/μl) |
30 μl × 1 支 |
Reverse primer2 (20 pmol/μl) |
30 μl × 1 支 |
Seq primers: |
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Seq forward (10 pmol/μl) |
20 μl × 1 支 |
Seq internal (10 pmol/μl) |
20 μl × 1 支 |
Seq reverse (10 pmol/μl) |
20 μl × 1 支 |
Positive Control DNA (1 ng/μl ) |
10 μl × 1 支 |
16S-free H2O |
1 ml × 3 支 |
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* PCR Premix中含有TaKaRa Ex Taq、反應(yīng)用Buffer、dNTP Mixture等,應(yīng)盡量避免反復(fù)凍融。 |
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■ 制品說明 |
本試劑盒是PCR擴增細菌16S rDNA的試劑盒,通過進一步對PCR擴增的DNA片段進行序列分析,可以鑒定被檢測細菌的種類。細菌的rRNA是細胞內(nèi)含量最多的RNA,約占RNA總量的80%以上,其分子量大,種類多,由高度保守區(qū)和可變區(qū)組成。細菌的rRNA包括5S、16S、23S,其中5S rRNA信息量少,不適合分析。23S rRNA盡管分子大,信息量多,但堿基突變速度較快,同樣不適用于細菌鑒定。相比之下16S rRNA的遺傳較為穩(wěn)定,長度在1,550±200 bp左右,代表信息量適中,是研究系統(tǒng)進化的好材料。目前已經(jīng)報道了10,000種以上的細菌16S rDNA序列。通過對16S rDNA的序列分析,可以將細菌劃分到屬或種。
16S rDNA可以通過PCR法擴增獲得,由于16S rDNA的兩端較為保守,可以在這段保守區(qū)域設(shè)計引物,擴增鑒定細菌的16S rRNA基因,然后進行DNA測序,再將其DNA序列與GenBank中的已知序列進行同源性比較后,可以判定檢測細菌的種類。
本試劑盒中包含了進行細菌16S rDNA PCR擴增的所有試劑,同時還提供了三條測序用引物(正向測序引物Seq forward、反向測序引物Seq reverse、中間測序引物Seq internal)。PCR擴增引物可以擴增細菌16S rDNA前500 bp的DNA片段(Forward primer/ Reverse primer1),以及全序列的DNA片段(Forward primer/ Reverse primer2)。16S rDNA的前500 bp 序列變化較大,包含有豐富的細菌種屬的特異性信息,進行DNA測序時一個測序反應(yīng)即可測通,是一種較為經(jīng)濟便捷的16S rDNA鑒定方法;如果前500 bp序列不足以反映細菌的種屬信息時,則可以進行16S rDNA的全序列PCR擴增及DNA測序,得到較為全面的16S rDNA序列信息。
對于難以培養(yǎng)、生化反應(yīng)不明顯及傳統(tǒng)表型方法不能鑒定的細菌,使用本試劑盒鑒定未知細菌種類尤為方便。
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■ 保存 |
-20℃保存,使用時請于冰中融化。 |
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■ 注意事項 |
1. 操作注意。
① 本實驗所使用的試劑極易污染,實驗盡可能在超凈工作臺中進行。
② 實驗人員應(yīng)穿無細菌污染的實驗服,戴口罩和手套,預(yù)先用70%乙醇對實驗器具進行消毒等。
③ 實驗應(yīng)使用專用的儀器和耗材,例如:專用的微量移液器及配套的槍頭。開啟Microtube要小心,防止污染等。
2. PCR Premix 的使用方法。
PCR Premix中含有TaKaRa Ex Taq,應(yīng)盡量避免反復(fù)凍融。
3. 實驗用細菌應(yīng)為純菌,以確保實驗的可信度。 |
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