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產(chǎn)品選擇指南

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當(dāng)前位置:首頁> 產(chǎn)品選擇指南 > 限制酶 > 限制酶基本信息 > 可用于DNA甲基化分析的CpG甲基化敏感型限制性內(nèi)切酶
可用于DNA甲基化分析的CpG甲基化敏感型限制性內(nèi)切酶
 

當(dāng)DNA識別序列中的堿基被甲基化時,一些限制性內(nèi)切酶因甲基化堿基的類型和位置無法切斷DNA。
將這些甲基化敏感限制性內(nèi)切酶與基因工程方法(如PCR或qPCR)相結(jié)合,可以更容易地進行哺乳動物基因組的DNA甲基化分析,這是表觀遺傳分析的方法之一。
下表描述了可用于哺乳動物基因組DNA甲基化分析的CpG甲基化敏感型限制性內(nèi)切酶,即受CpG methylase(5mCG)甲基化影響而不能進行DNA切斷的限制性內(nèi)切酶。
 
受CpG methylase(5mCG)甲基化影響的限制性內(nèi)切酶
因序列條件受CpG methylase(5mCG)甲基化影響的限制性內(nèi)切酶
 
此外,大腸桿菌來源的甲基化影響描述如下:
受dam methylase甲基化影響的限制性內(nèi)切酶(G6mATC)
受dcm methylase甲基化影響的限制性內(nèi)切酶(C5mCWGG)
 
受CpG methylase影響的限制性內(nèi)切酶
 
限制酶 識別位點 無法切斷的序列*2 CpG dam dcm 無法切斷的序列*2
  Aat II GACGT/C
GA5mCGTC
GACGT5mC(G)
     
  Acc I GT/MKAC
GT5mCGAC
GTMKA5mC(G)
     
  Acc II CG/CG
5mCG5mCG
5mCGCG
     
  Afa I GT/AC
GTA5mC(G)
     
  Aor13H I T/CCGGA
TC5mCGGA
     
  Aor51H I AGC/GCT
AG5mCGCT      
  Apa I GGGCC/C
GGGCC5mC(G)
 
GGGCC5mC(WGG)
  ApaL I G/TGCAC
GTGCA5mC(G)
     
  Bal I GCCN4/NGGC
GCCN5GG5mC(G)  
GGNC5mC(WGG)
  BspT104 I TT/CGAA
TT5mCGAA
     
  BssH II G/CGCGC
G5mCG5mCGC
G5mCGCGC
     
  Cfr10 I R/CCGGY
RC5mCGGY
     
  Cla I AT/CGAT
AT5mCGAT
  (G)6mATCGAT
ATCG6mAT(C)
  Cpo I CG/GWCCG
5mCGGWC5mCG
     
  Eae I Y/GGCCR
YGGC5mCG
 
YGGC5mCA(GG)
  Eco52 I C/GGCCG
5mCGGC5mCG
5mCGGCCG
CGGC5mCG
     
 
限制酶 識別位點 無法切斷的序列*2 CpG dam dcm 無法切斷的序列*2
  Hae II RGCGC/Y
RG5mCGCY
     
  Hap II C/CGG
C5mCGG
     
  Hha I GCG/C
G5mCGC
GCG5mC(G)
     
  Mlu I A/CGCGT
A5mCG5mCGT
     
  Nae I GCC/GGC
GC5mCGGC
GCCGG5mC(G)
     
  Nhe I G/CTAGC
GCTAG5mC(G)
    NT
  Not I GC/GGCCGC
G5mCGGC5mCGC
     
  Nru I TCG/CGA
T5mCG5mCGA
T5mCGCGA
  TCGCG6mA(TC)
  PmaC I CAC/GTG
CA5mCGTG
     
  Psp1406 I AA/CGTT
AA5mCGTT
     
  Pvu I CGAT/CG
5mCGAT5mCG
     
  Sac II CCGC/GG
C5mCG5mCGG
C5mCGCGG
     
  Sal I G/TCGAC
GT5mCGAC
     
  Sau3A I GATC
GAT5mC(G)
     
  Sma I CCC/GGG
CC5mCGGG
     
  SnaB I TAC/GTA
TA5mCGTA
     
  VpaK11B I G/GWCC
GGWC5mC(G)
 
GGWC5mC(WGG)
 
*1 Msp I是Hap II的同裂酶,不受CpG甲基化酶的影響。
*2()中的序列表示限制性內(nèi)切酶識別序列以外的序列。
 
M:A or C
N:A or C or G or T
R:A or G
Y:C or T
W:A or T
S:C or G
H:A or C or T
D:A or G or T
K:G or T
 
 
 

頁面更新:2024-06-14 16:01:44