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SMART-Seq^® Total RNA Pico Input (ZapR^™ Mammalian)
品牌	Code No.	產(chǎn)品名稱	包裝量	價格（元）	說明書	數(shù)量
Clontech	634357	SMART-Seq^® Total RNA Pico Input (ZapR^™ Mammalian)	24 Rxns	￥17,781
Clontech	634358	SMART-Seq^® Total RNA Pico Input (ZapR^™ Mammalian)	96 Rxns	￥48,794
Clontech	634359	SMART-Seq^® Total RNA Pico Input (ZapR^™ Mammalian)	4 × 96 Rxns	￥175,660
Clontech	634756	Unique Dual Index Kit (1–24)	24 Rxns	￥2,737
Clontech	634752	Unique Dual Index Kit (1–96)	96 Rxns	￥7,370
Clontech	634753	Unique Dual Index Kit (97–192)	96 Rxns	￥7,370
Clontech	634754	Unique Dual Index Kit (193–288)	96 Rxns	￥7,370
Clontech	634755	Unique Dual Index Kit (289–384)	96 Rxns	￥7,370

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低起始量鏈特異性RNA-Seq分析
SMART-Seq^® Total RNA Pico Input (ZapR^™ Mammalian)

· 高靈敏度：可以250 pg-10 ng的人、小鼠或大鼠總RNA起始
· 兼容性廣：可以不同品質(zhì)RNA(包括FFPE、LCM樣品以及cfRNA等)制備文庫，獲得高再現(xiàn)性的數(shù)據(jù)
· 性能提升：無需大量添加 PhiX 的情況下也能實現(xiàn)較高比率的clusters passing filter（%PF），識別更多轉(zhuǎn)錄本，重復(fù)更少
· 鏈特異性：保留轉(zhuǎn)錄本鏈來源信息，識別準確度高
· 操作簡便：整體流程只需6 h，改良buffer配方，縮短文庫純化時間
· Illumina文庫：搭配Uinque Dual Index使用，最多可制備384種Illumina文庫

注：SMART-Seq Total RNA Pico Input (ZapR Mammalian)是SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v2 - Pico Input Mammalian的替代品，性能提升，如下所示：

i：提升ZapR技術(shù)去除rRNA cDNA 效率，以更好地剔除不需要的reads信息
ii：試劑盒中不包含index，但可以與Unique Dual Index (UDI) kits（24 Rxns，96 Rxns）靈活地搭配使用

■ 產(chǎn)品說明

SMART-Seq Total RNA Pico Input (ZapR Mammalian) 設(shè)計用于從皮克級總RNA(250 pg-10 ng)中高效制備測序文庫。本試劑盒采用SMART技術(shù)(Switching Mechanism at the 5' end of RNA Template) ，適用于高品質(zhì)、部分降解及低品質(zhì)RNA（如來自于FFPE或LCM樣品）。本試劑盒是一體化操作流程，保留了鏈來源信息，并且不需要下游文庫制備，在反轉(zhuǎn)錄和PCR擴增過程中就可以添加indexes和接頭。包括文庫構(gòu)建及純化的全部操作流程只需6 h。
核糖體RNA在總RNA中占有很高的比重（約90%）。在制備文庫前從總RNA中去除核糖體來源的RNA，有利于降低測序成本，提高統(tǒng)計數(shù)據(jù)的mapping率。但是在以微量樣品起始時，去除rRNA的前處理操作，會造成純化后的樣品太少而不能制備高品質(zhì)測序文庫。本試劑盒采用特異針對哺乳動物rRNA和部分線粒體RNA的探針去除核糖體cDNA（來源于核糖體RNA的cDNA片段）。
采用本試劑盒所構(gòu)建的文庫，在無需大量添加 PhiX 的情況下也能實現(xiàn)較高比率的clusters passing filter（%PF），即使在基于雙通道SBS技術(shù)的Illumina平臺（如 NextSeq^® 和 MiniSeq^™）以及 HiSeq^® 3000/4000上也是如此。每個run可以獲得更多的生物學(xué)相關(guān)測序reads，反過來減少了測序成本。同時，可以獲得更多的特異轉(zhuǎn)錄本，更低的rRNA、mtRNA比對率和重復(fù)率。

不同樣品起始量解決方案
·10-100 ng總RNA，推薦使用SMART-Seq Total RNA Mid Input
·100 ng-1 μg總RNA，推薦使用SMART-Seq Total RNA High Input (RiboGone^™ Mammalian)

■ 流程概要

■ 性能數(shù)據(jù)

實驗方法

選擇250 pg和10 ng的人腦RNA樣本起始，使用SMART-Seq Total RNA Pico Input制備文庫。之后分別采用ZapR Mammalian rRNA Depletion Kit試劑盒中的模塊處理（+）和未處理（-），并通過PCR擴增進行富集或者不進行處理。最后使用CogentAP 對2x10⁶ PE reads進行數(shù)據(jù)分析。

☆ 不同起始量RNA樣本起始，均可有效去除核糖體RNA來源cDNA