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產(chǎn)品選擇指南

技術服務信息

當前位置:首頁> 產(chǎn)品選擇指南 > NGS相關制品 > DNA-Seq > 通用型DNA-Seq分析ThruPLEX® DNA-Seq HV & ThruPLEX® DNA-Seq HV PLUS Kit
通用型DNA-Seq分析ThruPLEX® DNA-Seq HV & ThruPLEX® DNA-Seq HV PLUS Kit
品牌 Code No. 產(chǎn)品名稱 包裝量 價格(元) 說明書 數(shù)量
Clontech R400782 ThruPLEX® DNA-Seq HV PLUS Kit 24 Rxns ¥9,844
Clontech R400783 ThruPLEX® DNA-Seq HV PLUS Kit 96 Rxns ¥36,193
Clontech R400740 ThruPLEX® DNA-Seq HV 96 Rxns ¥27,884
Clontech R400741 ThruPLEX® DNA-Seq HV 24 Rxns ¥8,309
Clontech R400736 ThruPLEX® DNA-Seq HV Core Components 96 Rxns ¥25,026
Clontech R400737 ThruPLEX® DNA-Seq HV Core Components 24 Rxns ¥6,969
Clontech R400739 ThruPLEX® HV UDI 1-24 24 Rxns ¥2,746
Clontech R400738 ThruPLEX® HV UDI Set A 96 Rxns ¥12,141
無標題文檔
 
高起始量通用型DNA-Seq分析
ThruPLEX® DNA-Seq HV & ThruPLEX® DNA-Seq HV PLUS Kit
· 兼容更高起始量的多種樣本:5至200 ng FFPE DNA、cfDNA起始,30 μl建庫體積,無需濃縮樣本!
· 刪繁就簡:單管三步操作流程,2 h內完成文庫構建!
· 一致高效可靠:無畏起始量差異,高實驗重復性、更均一的文庫覆蓋度,高GC含量區(qū)域偏差更??!
· 更適用于臨床相關樣本及腫瘤學研究等應用領域!
· ThruPLEX® DNA-Seq HV PLUS Kit包含酶切片段步驟,提供完整文庫構建流程!
 
ThruPLEX® DNA-Seq HV產(chǎn)品說明
出色的NGS文庫構建系統(tǒng)必須具備“流線型”、簡便的操作流程,兼容更大的DNA起始量范圍,同時還必須保證結果的可靠性。Takara科學家特別優(yōu)化、研制的ThruPLEX DNA-Seq HV文庫構建系統(tǒng),具有流程完整、快速,文庫復雜度高、結果可靠性高、兼容困難樣本等特點。采用單管操作流程,市面上鮮有比ThruPLEX DNA-Seq HV流程更快速、更連貫、適合更高樣本通量的產(chǎn)品。此外,沒有同類產(chǎn)品的流程中需要耗時的磁珠純化步驟,ThruPLEX DNA-Seq HV單管操作的設計能大大減少珍貴樣本的損耗!使用時無需稀釋接頭,ThruPLEX DNA-Seq HV進一步減少了手動操作時間,刪繁就簡!
 
ThruPLEX DNA-Seq HV支持5-200 ng DNA起始,起始體積提升至30 μl,樣本無需濃縮!通過這樣的改進,ThruPLEX DNA-Seq HV所建文庫能獲得基因組覆蓋度更高、突變檢測更正確的測序數(shù)據(jù)。面對不同GC含量的樣本,我們的系統(tǒng)都能產(chǎn)生覆蓋度更均勻且一致的實驗數(shù)據(jù)。
 
■ 流程簡便,節(jié)約您的寶貴時間
(數(shù)據(jù)來源于Takara Bio USA, Inc.)
表1 Takara科學家分別采用5/200 ng DNA起始,比較了ThruPLEX DNA-Seq HV與其他品牌同類產(chǎn)品制備文庫的操作流程,建庫總時長為制備足量雙端Illumina文庫的時間。從上表可以看出,ThruPLEX DNA-Seq HV是唯一采用單管操作、無需接頭稀釋且過程中無需磁珠純化的系統(tǒng),建庫總時長與手動操作時間均為最短,操作最為便捷!
 
■ 不同GC含量,一致均勻覆蓋
實現(xiàn)一致、均一的GC覆蓋度并不容易,要求文庫構建系統(tǒng)對不同GC含量的基因組都能提供正確、均一的覆蓋。實驗結果證明:無論是以gDNA還是以不同GC含量的實際樣本起始,ThruPLEX DNA-Seq HV均能構建出GC覆蓋度均一的文庫!
 
 
■ “妥協(xié)”的FFPE 樣本,不“妥協(xié)”的DNA-Seq性能
若要長期保存臨床研究組織樣本,往往需要福爾馬林進行固定處理,處理后即為福爾馬林石蠟包埋樣本(FFPE)。但福爾馬林會造成樣本中的核酸降解,表現(xiàn)為核酸品質差、含量不足,致使后續(xù)的高品質文庫構建出現(xiàn)困難。ThruPLEX DNA-Seq HV采用優(yōu)化的技術與流程,無懼FFPE樣本的挑戰(zhàn)!
Takara科學家比較了ThruPLEX DNA-Seq HV與A公司的同類產(chǎn)品所建文庫的測序數(shù)據(jù),樣本分別是50 ng與5 ng起始的formalin-compromised樣本(模擬的FFPE樣本)、30 ng與5 ng起始的FFPE樣本,三次生物學重復。
 
圖1 ThruPLEX DNA-Seq HV所建Formalin compromised文庫具有更高的平均靶標覆蓋度 兩個試劑盒所建文庫采用AMPure磁珠純化、pool后用IDT xGEN Pan Cancer Panel (800kb human genome) 進行靶向富集,NextSeq 500/550 Mid Output Kit v2.5 (150 Cycles) 雙端測序。每個文庫downsample為5M reads,bowtie2軟件將數(shù)據(jù)align至hg19。VarDict Variant Caller進行突變分析,最低覆蓋度30X,最低等位基因突變頻率0.5%。(數(shù)據(jù)來源于Takara Bio USA, Inc.)
 
圖2 ThruPLEX DNA-Seq HV所建FFPE文庫能檢測到更多的突變 兩個試劑盒所建文庫的測序數(shù)據(jù),三次重復中至少有兩次檢測到陽性突變被計算為有效陽性突變。(數(shù)據(jù)來源于Takara Bio USA, Inc.)
 
ThruPLEX DNA-Seq HV PLUS Kit產(chǎn)品說明
ThruPLEX DNA-Seq HV PLUS Kit是在ThruPLEX DNA-Seq HV的基礎上,整合了ThruPLEX HV PLUS Enzymatic Fragmentation Module的完整文庫構建試劑盒。ThruPLEX DNA-Seq HV PLUS Kit保留了ThruPLEX HV的顯著功能,并且無需在文庫制備之前進行任何機械打斷或單獨的酶切片段化處理,從而實現(xiàn)了性能和速度的充分結合!
 
 
■ 更小的偏差,更真實再現(xiàn)樣品的原始信息能
測序文庫必須獲得樣品的完整序列信息來真實的反映樣本情況。起始量越低,則越難獲得覆蓋均一的測序數(shù)據(jù),如果建庫DNA起始量越低,則均一覆蓋模板的概率越低,使得文庫構建變得更加困難。另外,在較低的起始量濃度下,文庫重現(xiàn)性可能會受到影響。ThruPLEX DNA-Seq HV PLUS Kit在推薦起始量范圍內,均具有非常好的重現(xiàn)性!重要的是,在推薦的最低起始量5 ng的情況下,仍表現(xiàn)出色!
 
 
■ 更加卓越的覆蓋均一性,幫您還原真實的基因組信息
Takara科學家比較了ThruPLEX DNA-Seq HV PLUS Kit與A公司和B公司的同類產(chǎn)品所建文庫的測序數(shù)據(jù),樣本分別是50 ng與5 ng起始的NA12878 gDNA,三次生物學重復。(數(shù)據(jù)來源于Takara Bio USA, Inc.)
 
圖3 使用 NextSeq 500/550 Mid Output Kit v2.5 (150 Cycles) 雙端測序。每個文庫downsample為5M reads。藍色柱形圖顯示100-bp windows的GC含量分布。與其他兩種試劑盒相比,ThruPLEX DNA-Seq HV PLUS Kit生成的文庫顯示,覆蓋率更接近理想的歸一化覆蓋率。
 
上表數(shù)據(jù)顯示,相較于其他公司試劑盒,本試劑盒構建的文庫重復率更低,均一性更好! (數(shù)據(jù)來源于Takara Bio USA, Inc.)
 
 
 
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更多實驗數(shù)據(jù):
ThruPLEX® DNA-Seq HV
ThruPLEX® DNA-Seq HV PLUS Kit
ThruPLEX® DNA-Seq HV 與ThruPLEX® DNA-Seq HV PLUS Kit比較數(shù)據(jù)
 
 
 

頁面更新:2024-01-31 13:48:17

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