捕獲人的BCR轉(zhuǎn)錄本完整V(D)J 可變區(qū) SMART-Seq Human BCR (with UMIs) |
· 完整的BCR分析—支持分析重鏈(IgG, IgM, IgA, IgD, IgE) 和輕鏈 (IgK, IgL) · 靈活的樣本起始條件—支持PBMCs (10 ng - 1 μg)、B細(xì)胞(1-100 ng)、脾臟或骨髓(10 ng),全血(100 ng)來(lái)源的RNA起始 · 添加UMI建庫(kù),獲得更可靠測(cè)序數(shù)據(jù)—SMARTer Oligo上引入U(xiǎn)MI,用于校正測(cè)序錯(cuò)誤和PCR偏差 · 靈活的測(cè)序平臺(tái)選擇—可自由選擇V(D)J全長(zhǎng)分析,或只分析CDR3 |
■ 產(chǎn)品說(shuō)明 |
SMART-Seq Human BCR (with UMIs) 提供了一種靈敏、準(zhǔn)確、優(yōu)化的BCR NGS庫(kù)分析方法。該試劑盒整合SMART(Switching Mechanism at 5' end of RNA Template)全長(zhǎng)cDNA合成技術(shù)與5’RACE技術(shù),可捕獲重鏈(IgG/M/D/A/E) 和輕鏈 (IgK/L)基因完整的V(D)J可變區(qū),用于后續(xù)NGS分析。 該試劑盒支持不同起始量的RNA(RIN≥8,取決于樣本類型)起始,均可獲得高品質(zhì)的測(cè)序文庫(kù)。比如外周血單核細(xì)胞(PBMC)純化的10 ng-1 μg的總RNA, B細(xì)胞純化的1-100 ng的總RNA,脾臟或骨髓10 ng的總RNA,或者全血來(lái)源的100 ng的總RNA。 該試劑盒還包括特別的分子條形碼(UMI),可以消除PCR錯(cuò)誤或duplication以及測(cè)序偏向,從而確保獲得更準(zhǔn)確和可靠的結(jié)果。此外,搭配使用的雙端特殊index(UDI,Unique Dual Index),可以提供完整的從樣品到文庫(kù)構(gòu)建的實(shí)驗(yàn)體驗(yàn)。 |
■ 流程概要 |
■ 不同起始量克隆型檢測(cè)數(shù)據(jù) |
圖1 不同的RNA起始量,均能獲得高靈敏度和重復(fù)性的克隆型檢測(cè)數(shù)據(jù) |
從10 ng、100 ng和1,000 ng人PBMC細(xì)胞總RNA中,利用本試劑盒制備BCR分析IgA、IgD、IgG、IgM、IgK和IgL文庫(kù)。使用Cogent NGS Immune Profiler Software分析測(cè)序數(shù)據(jù)。 |
關(guān)聯(lián)產(chǎn)品:Unique Dual Index Kit |
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頁(yè)面更新:2024-01-17 15:54:21