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產(chǎn)品選擇指南

技術(shù)服務(wù)信息

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小鼠BCR分析SMART-Seq Mouse BCR (with UMIs)
品牌 Code No. 產(chǎn)品名稱(chēng) 包裝量 價(jià)格（元） 說(shuō)明書(shū) 數(shù)量
Clontech 634352 SMART-Seq® Mouse BCR (with UMIs) 24 Rxns ￥19,351
Clontech 634353 SMART-Seq® Mouse BCR (with UMIs) 96 Rxns ￥63,718
Clontech 634351 SMART-Seq® Mouse BCR (with UMIs) 4 x 96 Rxns ￥239,105
Clontech 634756 Unique Dual Index Kit (1–24) 24 Rxns ￥2,737
Clontech 634752 Unique Dual Index Kit (1–96) 96 Rxns ￥7,370
Clontech 634753 Unique Dual Index Kit (97–192) 96 Rxns ￥7,370
Clontech 634754 Unique Dual Index Kit (193–288) 96 Rxns ￥7,370
Clontech 634755 Unique Dual Index Kit (289–384) 96 Rxns ￥7,370
無(wú)標(biāo)題文檔
SMART-Seq Mouse BCR (with UMIs)
· 完整的BCR分析：支持分析重鏈(IgG, IgM, IgA, IgD, IgE) 和輕鏈 (IgK, IgL)
· 靈活的樣本起始條件：支持10 ng - 1 μg 小鼠脾臟、骨髓、淋巴結(jié)、全血以及PBMC來(lái)源的高質(zhì)量RNA起始（RIN>7）
· 簡(jiǎn)化的操作流程：組分中的重、輕免疫球蛋白鏈引物以及酶均是預(yù)混形式
· 更可靠測(cè)序數(shù)據(jù)：SMARTer Oligo上引入U(xiǎn)MI，用于校正測(cè)序錯(cuò)誤和PCR偏差
· 靈活的測(cè)序平臺(tái)選擇：可自由選擇V(D)J全長(zhǎng)分析，或只分析CDR3
 
■ 產(chǎn)品說(shuō)明
SMART-Seq Mouse BCR (with UMIs)是一款小鼠BCR NGS文庫(kù)構(gòu)建試劑盒。該試劑盒整合SMART（Switching Mechanism at 5' end of RNA Template）全長(zhǎng)cDNA合成技術(shù)與5’RACE技術(shù)，可捕獲重鏈(IgA/D/E/G/M) 和輕鏈 (IgK/L)基因完整的V(D)J可變區(qū)，用于后續(xù)NGS分析。
該試劑盒支持不同起始量的RNA（RIN>7）起始，均可獲得高品質(zhì)的測(cè)序文庫(kù)。比如小鼠脾臟、骨髓或者外周血單核細(xì)胞（PBMC）純化的10 ng-1 μg的總RNA，也支持從小鼠血液或者淋巴結(jié)中提取的RNA樣本。
該試劑盒中的重、輕免疫球蛋白鏈引物以及酶均是預(yù)混形式，減少了試劑組分?jǐn)?shù)量和操作步驟。另外該試劑盒還包括特別的分子條形碼（UMI），可以消除PCR錯(cuò)誤或duplication以及測(cè)序偏向，從而確保獲得更準(zhǔn)確和可靠的結(jié)果。此外，搭配使用的雙端特殊index（UDI，Unique Dual Index），可以提供完整的從樣品到文庫(kù)構(gòu)建的實(shí)驗(yàn)體驗(yàn)。
該試劑盒所建文庫(kù)支持更多樣的測(cè)序平臺(tái)。既支持Miseq平臺(tái)（分析V(D)J全長(zhǎng)信息），也支持其它Illumina平臺(tái)（分析CDR3區(qū)），節(jié)約成本。
 
■ 應(yīng)用
· 用于分析組織和循環(huán)系統(tǒng)中的B細(xì)胞的克隆組織和多樣性，了解它們?nèi)绾斡绊態(tài)細(xì)胞的分化途徑和功能。
· 發(fā)現(xiàn)具有高親和力的BCR，以便更好地為疫苗接種或傳染病治療提供指導(dǎo)。
· 追蹤抗原特異性B細(xì)胞在HIV以及其他疾病的小鼠模型中過(guò)繼轉(zhuǎn)移后的變化和遷移。
· 檢查BCR序列，以研究針對(duì)新表位的自體抗體隨時(shí)間的變化，以及這些變化如何與嚴(yán)重的自身免疫疾病相關(guān)聯(lián)，如狼瘡。
 
■ 建庫(kù)原理
 
■ 不同起始量的克隆型檢測(cè)數(shù)據(jù)
為了評(píng)價(jià)SMART-Seq Mouse BCR (with UMIs)的性能，以10 ng，100 ng和1,000 ng小鼠脾臟來(lái)源RNA起始制備文庫(kù)，生成150萬(wàn)個(gè)測(cè)序reads。
Panel A. 檢測(cè)所有重鏈(IgA/D/G/M，除了IgE，因?yàn)樗谡Ｐ∈髽颖局械谋磉_(dá)量非常低)和輕鏈 (IgK/L)。結(jié)果顯示，隨著起始量的增加，檢測(cè)到的克隆型數(shù)量也隨之增加。
Panel B. 結(jié)果顯示，重鏈和輕鏈的克隆型數(shù)量隨著起始量的增加也隨之增加。
 
 
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頁(yè)面更新：2024-01-17 16:00:45

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