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當(dāng)前位置：首頁> 產(chǎn)品選擇指南 > 自動化系統(tǒng) > 高通量單細(xì)胞分選系統(tǒng)ICELL8應(yīng)用 > 自動化高通量的單細(xì)胞全長轉(zhuǎn)錄組分析

自動化高通量的單細(xì)胞全長轉(zhuǎn)錄組分析
品牌	Code No.	產(chǎn)品名稱	包裝量	價格（元）	說明書	數(shù)量
Clontech	640183	ICELL8^® 250v Chip	1 Chip	詢價
Clontech	640202	SMART-Seq^® ICELL8^® Reagent Kit	1 Chip	詢價
Clontech	640203	SMART-Seq^® ICELL8^® Reagent Kit	3 Chips	詢價
Clontech	640204	SMART-Seq^® ICELL8^® Reagent Kit	5 Chips	詢價
Clontech	640205	SMART-Seq^® ICELL8^® Indexing Primer Set – A	1 Chip	詢價
Clontech	640218	SMART-Seq^® ICELL8^® Indexing Primer Set – B	1 Chip	詢價
Clontech	640212	ICELL8^® Collection Kit - L	1 Pkg	詢價
Clontech	640206	ICELL8^® Loading Kit – B	1 Pkg	詢價
Clontech	640048	ICELL8^® Collection Kit	1 Pkg	詢價
Clontech	640192	ICELL8^® 384-Well Source Plate and Seal (5/pack)	Each	詢價

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SMART-Seq技術(shù)助力ICELL8 cx系統(tǒng)單細(xì)胞全長轉(zhuǎn)錄組分析方案

全長序列覆蓋可以實現(xiàn)對整個轉(zhuǎn)錄的差異表達(dá)分析，并且可以對基因融合、剪接體這類生物標(biāo)志物進(jìn)行檢測。高靈敏度的SMART-Seq Pro可以勝任以上分析需求。
SMART-Seq Pro Application Kit將SMART-Seq試劑與ICELL8 cx Single-Cell System（Cat No. 640188）相結(jié)合，并整合了生物信息學(xué)工具，提供一套端到端的單細(xì)胞全長轉(zhuǎn)錄組分析流程，一次實驗可以對1,200~1,500個分離的單細(xì)胞進(jìn)行高效的全長轉(zhuǎn)錄組分析。
通過ICELL8 cx系統(tǒng)將細(xì)胞分注到ICELL8 350v Chip（Cat No. 640019）空白微孔芯片中。使用ICELL8 cx CellSelect Software鑒定出含單個細(xì)胞的微孔，文庫構(gòu)建試劑只被分注到這些選中的微孔中。經(jīng)過一系列分注和擴(kuò)增步驟后，獲得無偏倚的全長cDNA，并通過Illumina Bead-Linked Transposome（BLT）完成酶切片段化。在這一擴(kuò)展性的工作流程中，cDNA擴(kuò)增階段引入了Illumina特異性接頭序列，生成的文庫已連接index接頭，可直接用于Illumina測序平臺。測序過程結(jié)束后，獲得的測序數(shù)據(jù)可直接導(dǎo)入Cogent NGS軟件工具進(jìn)行生物信息學(xué)分析，解釋測序結(jié)果。

更多孔板測序應(yīng)用，請參見 單細(xì)胞RNA-Seq / DNA-Seq

■ 概述

· 端到端的解決方案：從文庫制備到測序數(shù)據(jù)分析工具
· 覆蓋全長mRNA：捕獲轉(zhuǎn)錄組中“深藏”的關(guān)鍵生物標(biāo)志物，如基因融合、剪接異構(gòu)體
· 高通量單細(xì)胞分析：可以平行地從＞1,000個單細(xì)胞中生成測序數(shù)據(jù)
· 樣品配置靈活：一次實驗最多可對八種細(xì)胞樣品進(jìn)行分析
· 減少樣品操作：減小數(shù)據(jù)波動，構(gòu)建測序文庫前自動鑒定并分選出感興趣的細(xì)胞，僅對這些細(xì)胞進(jìn)行試劑分注
· Illumina平臺測序文庫：制備的測序文庫適用于Illumina全系平臺

■應(yīng)用

用于Illumina平臺上高通量全長單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序文庫制備

圖1. SMART-Seq Pro和Smart-seq2在PBMCs中基因檢測結(jié)果比較

Technote：
點擊圖片查看

點擊下載SMART-Seq Pro海報

頁面更新：2024-10-08 14:02:55

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