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分子標(biāo)簽SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 - Pico Input Mammalian
品牌	Code No.	產(chǎn)品名稱	包裝量	價(jià)格（元）	說明書	數(shù)量
Clontech	634485	SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 - Pico Input Mammalian	24 Rxns	￥31,669
Clontech	634486	SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 - Pico Input Mammalian	48 Rxns	￥48,927
Clontech	634487	SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 - Pico Input Mammalian	96 Rxns	￥66,373
Clontech	634488	SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 - Pico Input Mammalian	192 Rxns	￥118,606

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無標(biāo)題文檔

帶分子標(biāo)簽的微量樣本的鏈特異RNA-Seq分析
SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 - Pico Input Mammalian

· 高靈敏度：可以人、大鼠或小鼠來源的250 pg-10 ng的總RNA或10-1000個(gè)細(xì)胞起始
· 添加UMI：校正來自PCR錯(cuò)誤、重復(fù)序列以及序列錯(cuò)誤的讀取
· 用途廣泛：能分析質(zhì)量較差的FFPE、LCM以及cfRNA來源的樣本
· 操作簡(jiǎn)便：僅需要7.5小時(shí)即可完成文庫構(gòu)建
· 無縫銜接Illumina測(cè)序：直接制備多達(dá)192種index的Illumina^® -ready文庫

SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 - Pico Input Mammalian（Pico v3）設(shè)計(jì)用于從皮克級(jí)總RNA(250 pg-10 ng)中高效制備Illumina測(cè)序文庫。本試劑盒采用的技術(shù)適用于高品質(zhì)、部分降解及低品質(zhì)RNA（如來自于FFPE或LCM樣品）。升級(jí)產(chǎn)品與原有SMARTer 皮克級(jí)產(chǎn)品相比，提升了在所有Illumina測(cè)序平臺(tái)的測(cè)序性能，并且還添加特別的分子條形碼（UMI），從而可以消除PCR錯(cuò)誤或duplication以及測(cè)序偏向。

本試劑盒采用一體化操作流程，保留了鏈來源信息，在反轉(zhuǎn)錄和PCR擴(kuò)增過程中就可以添加indexes和接頭。整個(gè)流程，包括文庫構(gòu)建及純化僅需約7.5小時(shí)。
該試劑盒包含SMARTer RNA Unique Dual Index Kit - 24U (Code No. 634451)。另外也可以與SMARTer RNA Unique Dual Index Kits (Code No. 634452 & 634457，可單獨(dú)購買）搭配使用，最多可構(gòu)建多達(dá)192種indexes文庫。

圖1. SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 - Pico Input Mammalian技術(shù)流程

圖2. 使用SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 - Pico Input Mammalian制備文庫的結(jié)構(gòu)特征

接頭序列包含：通過PCR 1反應(yīng)添加的可以與Illumina流動(dòng)池結(jié)合生成簇的P7、P5序列（P7以淡藍(lán)色表示，P5以紅色表示），用于區(qū)分單個(gè)lane上多個(gè)樣本的Index序列（Index 1 [i7] 序列連接在P7端，Index 2 [i5]連接在P5端）。并且還包括識(shí)別測(cè)序引物區(qū)域的Read 2（紫色）和 Read 1（綠色）。通過Read 1起始得到的原始RNA的反義鏈序列，Read 2起始獲得的是原始RNA的正義鏈序列。其中，通過Read 2起始時(shí)，前8個(gè)堿基是UMI（深紫色），UMI之后的3個(gè)堿基（XXX）是Pico v3 Adapter衍生的序列。

表 1. 不同樣本起始量的分析結(jié)果。

以0.5、1、5和10 ng人肺FFPE組織提取的總RNA起始，采用SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 - Pico Input Mammalian制備RNA-Seq文庫（均做兩個(gè)重復(fù)），并使用NextSeq 500進(jìn)行測(cè)序。

Technote：
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SMARTer Stranded RNA-Seq Pico v3:
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頁面更新：2023-07-26 16:12:16

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