捕獲人的BCR轉(zhuǎn)錄本完整V(D)J 可變區(qū) SMART-Seq Human BCR (with UMIs) |
· 完整的BCR分析—支持分析重鏈(IgG, IgM, IgA, IgD, IgE) 和輕鏈 (IgK, IgL) · 靈活的樣本起始條件—支持PBMCs (10 ng - 1 μg)、B細胞(1-100 ng)、脾臟或骨髓(10 ng),全血(100 ng)來源的RNA起始 · 添加UMI建庫,獲得更可靠測序數(shù)據(jù)—SMARTer Oligo上引入UMI,用于校正測序錯誤和PCR偏差 · 靈活的測序平臺選擇—可自由選擇V(D)J全長分析,或只分析CDR3 |
■ 產(chǎn)品說明 |
SMART-Seq Human BCR (with UMIs) 提供了一種靈敏、準確、優(yōu)化的BCR NGS庫分析方法。該試劑盒整合SMART(Switching Mechanism at 5' end of RNA Template)全長cDNA合成技術(shù)與5’RACE技術(shù),可捕獲重鏈(IgG/M/D/A/E) 和輕鏈 (IgK/L)基因完整的V(D)J可變區(qū),用于后續(xù)NGS分析。 該試劑盒支持不同起始量的RNA(RIN≥8,取決于樣本類型)起始,均可獲得高品質(zhì)的測序文庫。比如外周血單核細胞(PBMC)純化的10 ng-1 μg的總RNA, B細胞純化的1-100 ng的總RNA,脾臟或骨髓10 ng的總RNA,或者全血來源的100 ng的總RNA。 該試劑盒還包括特別的分子條形碼(UMI),可以消除PCR錯誤或duplication以及測序偏向,從而確保獲得更準確和可靠的結(jié)果。此外,搭配使用的雙端特殊index(UDI,Unique Dual Index),可以提供完整的從樣品到文庫構(gòu)建的實驗體驗。 |
■ 流程概要 |
■ 不同起始量克隆型檢測數(shù)據(jù) |
圖1 不同的RNA起始量,均能獲得高靈敏度和重復性的克隆型檢測數(shù)據(jù) |
從10 ng、100 ng和1,000 ng人PBMC細胞總RNA中,利用本試劑盒制備BCR分析IgA、IgD、IgG、IgM、IgK和IgL文庫。使用Cogent NGS Immune Profiler Software分析測序數(shù)據(jù)。 |
關(guān)聯(lián)產(chǎn)品:Unique Dual Index Kit |
產(chǎn)品詳情請點擊: |
頁面更新:2024-01-17 15:54:21