高通量單細胞全基因組擴增
Shasta Whole-Genome Amplification Kit |
· 利用出色的PicoPLEX試劑,一次運行分析多達1,500單細胞
· 獲得全基因組覆蓋,檢測片段化(segmental)CNV和染色體臂水平CNV
· 可以對SNV進行生物信息學分析
· 便捷的自動化工作流程
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■ 應用
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· 單細胞分辨率CNV檢測
· 腫瘤亞克隆分析
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溫馨提示:Shasta™ Whole-Genome Amplification Kit - 2 Chip(Code No. 640286)可適配儀器型號ICELL8 cx Single-Cell System(Code No. 64188)、Shasta™ Single Cell System(Code No. 64282)
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■ 案例 |
· 在不同染色體和細胞系中檢測不同的拷貝數(shù)分布
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圖1. 來自GM05067、GM22601、GM12878、K562細胞的單細胞拷貝數(shù)分析案例。
黑色線段表示片段中位數(shù)。分析結果顯示,GM05067細胞4號染色體上出現(xiàn)拷貝數(shù)丟失,9號染色體上拷貝數(shù)增加,2倍體GM12878未檢測出CNVs。K562細胞檢測結果顯示出超倍性,一種快速增值癌癥細胞的常見現(xiàn)象。
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圖2. 通過拷貝數(shù)分析結果的不同區(qū)分各種細胞類型
GM05067,GM22601,A_498,SKBR3的單細胞拷貝數(shù)分析聚類熱圖顯示了每種細胞類型的不同模式,如GM05067(綠色)9號染色體有拷貝數(shù)增加,GM22601(紅色)4號染色體有拷貝數(shù)缺失。
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(數(shù)據(jù)來源于Takara Bio USA, Inc.)
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