在設計酵母單雜交bait時需要考慮兩點:順式作用元件(cis-acting element)和啟動子序列。
①使用cis-acting元件:
■ 使用最少數(shù)量的cis-acting元件,cis-acting元件超過20bp時會增加非特異性結合。Clontech
檢測的最長的單拷貝cis-acting元件為20bp。
■ 如果你的cis-acting元件超過100bp,使用1個或2個拷貝。需要注意的是這么長的片段會提高假
陽性。
②使用啟動子序列:
■ bait中不要包含TATA box。
■ 拷貝數(shù):如果啟動子序列小于100 bp,使用2個拷貝作為bait。如果超過100 bp,使用1個拷貝
作為bait。
■ 檢測假陽性:構建好bait菌株后,檢測報告基因的本底表達,以確認任何非特異報告基因激活
(參考操作手冊)。
pAbAi空載的多克隆位點中Sma I和Xho I之間存在隱蔽的啟動子,這個MCS可以被某些酵母體內蛋白
識別。如果這段識別序列是完整的,pAbAi載體會表現(xiàn)出自激活活性。因此,我們推薦退火后的核苷
酸(插入片段)的3’端帶有Sal I了或Xho I酶切位點,而5’端可以是MCS中Sma I位點上游的任意的
單一酶切位點。同時,推薦采用mutant bait做為陰性對照。
頁面更新:2015-01-14 11:19:11