各種Reverse Transcriptase的區(qū)別如下:
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合成不了長鏈cDNA的原因如下:
1. RNase的原因(cDNA的電泳譜帶出現(xiàn)模糊)。
對使用的器具、試劑請盡可能干熱或者濕熱滅菌處理。同時,在反應(yīng)時請加入Recombinant RNase Inhibitor。
2. 反應(yīng)條件不適合(cDNA的合成量少)。
請通過預(yù)備實驗探討適合的反應(yīng)條件,此時所要研討的項目包括:酶量、鹽濃度、反應(yīng)溫度(37~65℃)、DTT濃度(0.5~10 mM)。
3. RNA結(jié)構(gòu)上的問題(出現(xiàn)低分子帶)。
嘗試提高反應(yīng)溫度,請使用隨機引物。
使用Recombinant RNase Inhibitor要注意以下問題:
1. 抑制活性的pH值范圍較廣,在pH7~8時表現(xiàn)最大活性。
2. 不要稀釋使用。蛋白濃度過低易失活,而攪拌更易失活,因此建議盡量使用原液填加到反應(yīng)體系中。
3. 起泡或強烈攪拌(Vortex等)會引起失活。
4. 不抑制RNase H活性。
使用例
cDNA第一條鏈的合成。
1. 在微量離心管中配制下列反應(yīng)液,全量為20 μl。
模板RNA | 1 | μg | |
5 × Reverse Transcriptase XL Buffer* | 4 | μl | |
dNTP Mixture(10 mM each) | 2 | μl | |
Oligo(dT)18 Primer或Random Primer(6-9 mer) | 50 | pmol | |
Recombinant RNase Inhibitor | 20 | U | |
AMV Rtase | 5 | U | |
DEPC H2O | Up to 20 | μl | |
* AMV(Code No. 2621)制品中附有。 |
2. 輕輕攪拌。
3. 室溫下10分鐘放置后,移入42℃恒溫槽中。
4. 42℃保溫1小時。
5. 把樣品移入冰中冷卻2分鐘。
(得到的反應(yīng)液可用于cDNA第二條鏈的合成。)
頁面更新:2020-04-27 10:40:10