大多數(shù)的植物及動物肌肉組織中都含有大量多糖,因此很難將其從RNA中除去,使用此類組織材料提取RNA時,建議增加RNAiso Plus的使用量。
對于從含有大量多糖的植物樣本中提取RNA時,推薦使用Fruit-mate for RNA Purification (Code No. 9192)作為預(yù)處理試劑。在異丙醇沉淀純化步驟中加入High-Salt Solution for Precipitation (Plant) (Code No. 9193)可有效除去RNA溶液中的多糖。
1. RNA應(yīng)使用TE Buffer稀釋后再進行吸光度值的測定,低離子強度或低pH值會使OD280值升高
2. 樣品裂解時加入的RNAiso Plus量偏少,造成蛋白分離不充分,可以再次對RNA溶液進行處理,以除去蛋白。
3. 含有裂解液的樣品經(jīng)勻漿混勻后未在室溫靜置,或靜置的時間不足5分鐘。這一步是從核酸中分離核蛋白的重要步驟。
4. 相分離后,吸取上清液時不小心接觸蛋白層造成污染。
5. RNA未充分溶解。
RNA濃度=(OD260-OD320)×稀釋倍數(shù)×0.04 μg/μl。
提取的RNA不溶,有以下幾點原因:
1.75%乙醇清洗沉淀后不要干燥時間過長或加熱干燥。
2.可以于60℃加熱5分鐘后再于冰上溶解數(shù)小時。
提取的RNA降解,有以下幾點原因:
1.使用的組織材料不夠新鮮。提取RNA的組織材料應(yīng)采用新鮮的組織材料,或?qū)⑿迈r組織材料用液氮迅速冷凍后置于-80℃保存。
2.提取RNA時使用的試劑及器材中混有RNA分解酶。
3.提取的組織材料中含有大量的RNA分解酶,而RNAiso Plus的添加量不夠。
提取的RNA中含有DNA污染,有以下幾點原因:
1.裂解組織或細胞使用的RNAiso Plus量偏少。
2.使用的組織材料中含有大量的有機溶劑(如:乙醇、異丙醇等)、高濃度的Buffer、堿性溶劑等。
3.如果提取的RNA中含有DNA時,可以使用Recombinant DNase I(RNase Free)(Code No. 270A)進行DNA消化。
不一定。上清液的顏色與提取的材料種類有關(guān)系,有的時候會因為帶有材料本身的色素而帶有一定的顏色,但是經(jīng)過后續(xù)的純化,提取的RNA一般不會帶有顏色的,不影響RNA的純度。
不同材料的RNA提取量請見下表:
組織材料 | 起始樣品量 | Total RNA提取量 |
全血 | 1 ml | 15~20 μg |
白細胞 | 1×107個 | 約20~40 μg |
小鼠肝臟 | 1 g | 約4,000~5,000 μg |
HL-60培養(yǎng)細胞 | 1×107個 | 約100 μg |
煙草葉片 | 1 g | 約1,000 μg |
小鼠腎臟 | 1 g | 約3,000 μg |
小鼠骨骼肌 | 1 g | 約1,500 μg |
小鼠腦 | 1 g | 約1,500 μg |
鯉魚骨骼肌 | 1 g | 約50 μg |
頁面更新:2020-04-30 11:07:48