我們推薦從新鮮的培養(yǎng)細胞中進行提取。但從本公司的實驗結(jié)果看,進行3次凍融處理的培養(yǎng)細胞也能提取檢出片斷化DNA,但收量明顯減少。
請將樣品分裝后在-20℃以下保存,盡量避免反復(fù)凍融。本公司的實驗結(jié)果表明:-20℃至少1個月穩(wěn)定;4℃保存時,至少7天穩(wěn)定。
可以考慮以下原因:
1. 細胞凋亡進行過度,有非特異性的DNA片段。推薦提早取樣時間。
2. 操作中混入DNase。應(yīng)防止DNase混入(如實驗戴手套等)。
可以考慮以下原因:
1. 沒有發(fā)生細胞凋亡??墒褂肐n situ Apoptosis Detection Kit(Code No. MK500)等確認(rèn)細胞凋亡是否發(fā)生。
2. DNA量太少,無法檢出。增加處理樣品的細胞數(shù)或者盡可能使用少量的TE Buffer溶解提取樣品DNA。
用細胞刮勺剝離較好,與使用Trypsin剝離細胞方法相比,前者剝離的細胞的片斷化DNA Ladder較為清晰。
在40℃左右加熱,即可溶解。溶解后的溶液可以正常使用,不影響實驗結(jié)果。
正常使用,6×Loading Buffer沒有問題。
適用于大部分培養(yǎng)細胞,也適用于其特性類似于培養(yǎng)細胞的細胞,比如使用BD Vacutainer® CPT (Becton Dickinson)從全血或者脾中提取的淋巴細胞。但本試劑盒不適用于組織。
細胞凋亡產(chǎn)生的DNA片斷化受以下因素影響:靶細胞、誘導(dǎo)劑及其濃度和誘導(dǎo)的時間等。另外,最近有報道說產(chǎn)生了細胞凋亡也可能沒有產(chǎn)生DNA片斷化。該問題沒有確切的答案。根據(jù)本公司的經(jīng)驗,推薦使用1 mM星型胞菌素(Sigma,Code No. S4400)處理的HL60細胞作為驗證提取成功的對照。
<使用HL60細胞實驗例>
在90 mm培養(yǎng)皿中,加入10 ml培養(yǎng)基,接種107個HL60細胞,然后加入星型胞菌素,使其終濃度為3 μM。在37℃、5%CO2條件下培養(yǎng)5小時*,全量離心回收細胞。
用PBS(-) Buffer清洗一次后,使其懸浮于少量的PBS(-) Buffer中,將5×106個細胞移入1.5 ml Microtube中,1,600×g室溫離心5分鐘。得到的片斷化DNA最終用20 μl TE Buffer溶解。取其中5 μl用3% Agarose Gel電泳檢測。
*:細胞的不同培養(yǎng)狀態(tài)下星型胞菌素的作用效果也不同。圖1中的ladder是對星型胞菌素處理3~5小時得到的結(jié)果。
推薦使用3%的NuSieve® 3:1 Agarose (Lonza Rockland)。
頁面更新:2020-05-11 15:55:22