Takara公司已經(jīng)驗(yàn)證菌種一覽表如下:
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酵母: | ||
15. 日本裂殖酵母 | Schizosaccharomyces japonicus | AS 2.1632 |
16. 產(chǎn)朊假絲酵母 | Candida utilis | AS 2.1180 |
17. 羅倫隱球酵母 | Cryptococcus laurentii | AS 2.114 |
18. 漢遜德巴利酵母 | Debaryomyces hansenii | AS 2.45 |
19. 油脂酵母 | Lipomyces starkeyi | AS 2.1390 |
20. 深紅酵母 | Rhodotorula rubr | AS 2.21 |
必須進(jìn)行負(fù)對照實(shí)驗(yàn),用以檢測是否有其它真菌污染,以保證實(shí)驗(yàn)的可信度。
PCR反應(yīng)的模板最好為基因組DNA,但也可以將真菌直接進(jìn)行PCR反應(yīng)。雖然真菌的細(xì)胞壁較厚,但也可以使用一些破壁方法釋放菌體DNA,然后直接進(jìn)行PCR反應(yīng)。
如果PCR產(chǎn)物比較短,在500 bp以下,此時(shí)通??梢允褂肧eq Forward Primer和Seq Reverse Primer中的任意一個(gè)引物進(jìn)行測序即可測通。但是,由于有些真菌的26S rDNA D1/D2區(qū)域及ITS區(qū)結(jié)構(gòu)比較復(fù)雜,具有多個(gè)A或多個(gè)T的連續(xù)結(jié)構(gòu),會導(dǎo)致測序結(jié)果出現(xiàn)套峰,此時(shí)建議實(shí)施雙向測序綜合分析實(shí)驗(yàn)結(jié)果。
頁面更新:2020-05-12 13:46:11