在設(shè)計(jì)酵母單雜交bait時(shí)需要考慮兩點(diǎn):順式作用元件(cis-acting element)和啟動(dòng)子序列。
①使用cis-acting元件:
■ 使用最少數(shù)量的cis-acting元件,cis-acting元件超過(guò)20bp時(shí)會(huì)增加非特異性結(jié)合。Clontech
檢測(cè)的最長(zhǎng)的單拷貝cis-acting元件為20bp。
■ 如果你的cis-acting元件超過(guò)100bp,使用1個(gè)或2個(gè)拷貝。需要注意的是這么長(zhǎng)的片段會(huì)提高假
陽(yáng)性。
②使用啟動(dòng)子序列:
■ bait中不要包含TATA box。
■ 拷貝數(shù):如果啟動(dòng)子序列小于100 bp,使用2個(gè)拷貝作為bait。如果超過(guò)100 bp,使用1個(gè)拷貝
作為bait。
■ 檢測(cè)假陽(yáng)性:構(gòu)建好bait菌株后,檢測(cè)報(bào)告基因的本底表達(dá),以確認(rèn)任何非特異報(bào)告基因激活
(參考操作手冊(cè))。
pAbAi空載的多克隆位點(diǎn)中Sma I和Xho I之間存在隱蔽的啟動(dòng)子,這個(gè)MCS可以被某些酵母體內(nèi)蛋白
識(shí)別。如果這段識(shí)別序列是完整的,pAbAi載體會(huì)表現(xiàn)出自激活活性。因此,我們推薦退火后的核苷
酸(插入片段)的3’端帶有Sal I了或Xho I酶切位點(diǎn),而5’端可以是MCS中Sma I位點(diǎn)上游的任意的
單一酶切位點(diǎn)。同時(shí),推薦采用mutant bait做為陰性對(duì)照。
頁(yè)面更新:2015-01-14 11:19:11