一般情況下組織或細(xì)胞中所能提取的DNA量如下表:
組織材料 | 起始樣品量 | 基因組DNA提取量 |
肝臟 | 100 mg | 300~400 μg |
腎臟 | 100 mg | 300~400 μg |
腦 | 100 mg | 200~300 μg |
心臟 | 100 mg | 200~300 μg |
HL60培養(yǎng)細(xì)胞 | 1×107個(gè) | 50~70 μg |
植物葉片 | 1 g | 20~200 μg |
E.coli Cells | 1×109個(gè) | 30~40 μg |
260 nm、320 nm、230 nm、280 nm下的吸光度分別代表了核酸、背景(溶液渾濁度)、鹽濃度和蛋白質(zhì)等有機(jī)物的吸光度值。OD260/OD280(R)體現(xiàn)了DNA中的蛋白質(zhì)等有機(jī)物的污染程度,質(zhì)量較好的DNA的R值應(yīng)在1.8~2.0之間,當(dāng)R<1.8時(shí),溶液中的蛋白質(zhì)等有機(jī)物的污染比較明顯;當(dāng)R>2.2時(shí),說明DNA已經(jīng)被水解成了單核苷酸。
在對(duì)核酸進(jìn)行吸光度檢測(cè)時(shí),需要注意稀釋液應(yīng)使用TE Buffer。
DNA濃度=(OD260-OD320)×稀釋倍數(shù)×0.05 μg/μl。
可以參考如下建議進(jìn)行改進(jìn):
1.向組織材料中加入DNAiso Reagent后,請(qǐng)充分研磨、勻漿,使其充分裂解。
2.組織材料中的DNA含量較少,提高起始材料使用量,本試劑不適用于微量組織材料DNA的提取。
3.增加DNAiso Reagent的添加量。
可以參考如下建議進(jìn)行改進(jìn):
1.75%乙醇清洗沉淀后不要干燥時(shí)間過長或加熱干燥。
2.基因組DNA在dH2O或TE Buffer中不易完全溶解,可以換成8 mM NaOH溶解。
3.當(dāng)基因組DNA的量過大時(shí)不易溶解,可以加長溶解時(shí)間或輕輕搖動(dòng)離心管以促進(jìn)溶解。
可能的原因如下:
1.DNA應(yīng)使用TE Buffer稀釋后再進(jìn)行吸光度值的測(cè)定,低離子強(qiáng)度或低pH值會(huì)使OD280值升高。
2.樣品裂解時(shí)加入的DNAiso Reagent量偏少,造成蛋白質(zhì)變性不充分,可以再次對(duì)DNA溶液進(jìn)行苯酚/氯仿抽提,以除去蛋白質(zhì)。
3.基因組DNA 未充分溶解。
提取的基因組DNA可能降解的原因如下:
1.使用的組織材料不夠新鮮。提取基因組DNA的組織材料應(yīng)采用新鮮的組織材料,或?qū)⑿迈r的組織材料用液氮迅速冷凍后置于-80℃保存。
2.操作劇烈造成基因組DNA斷裂,破壞了基因組DNA的完整性。
提取的基因組DNA中含有RNA污染,可能的原因如下:
1.組織材料或細(xì)胞裂解后未使用離心法除去RNA。
2.提取出的基因組DNA量較少時(shí),采用離心法而未使用纏繞法收集基因組DNA沉淀,容易帶來RNA污染。
3.如果提取的基因組DNA中含有RNA時(shí),可以對(duì)提取的基因組DNA進(jìn)行一次LiCl沉淀,以除去RNA污染,或者使用RNase進(jìn)行處理。
頁面更新:2020-04-28 16:02:23