我們推薦從新鮮的培養(yǎng)細(xì)胞中進(jìn)行提取。但從本公司的實(shí)驗(yàn)結(jié)果看,進(jìn)行3次凍融處理的培養(yǎng)細(xì)胞也能提取檢出片斷化DNA,但收量明顯減少。
請(qǐng)將樣品分裝后在-20℃以下保存,盡量避免反復(fù)凍融。本公司的實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明:-20℃至少1個(gè)月穩(wěn)定;4℃保存時(shí),至少7天穩(wěn)定。
可以考慮以下原因:
1. 細(xì)胞凋亡進(jìn)行過(guò)度,有非特異性的DNA片段。推薦提早取樣時(shí)間。
2. 操作中混入DNase。應(yīng)防止DNase混入(如實(shí)驗(yàn)戴手套等)。
可以考慮以下原因:
1. 沒(méi)有發(fā)生細(xì)胞凋亡。可使用In situ Apoptosis Detection Kit(Code No. MK500)等確認(rèn)細(xì)胞凋亡是否發(fā)生。
2. DNA量太少,無(wú)法檢出。增加處理樣品的細(xì)胞數(shù)或者盡可能使用少量的TE Buffer溶解提取樣品DNA。
用細(xì)胞刮勺剝離較好,與使用Trypsin剝離細(xì)胞方法相比,前者剝離的細(xì)胞的片斷化DNA Ladder較為清晰。
在40℃左右加熱,即可溶解。溶解后的溶液可以正常使用,不影響實(shí)驗(yàn)結(jié)果。
正常使用,6×Loading Buffer沒(méi)有問(wèn)題。
適用于大部分培養(yǎng)細(xì)胞,也適用于其特性類似于培養(yǎng)細(xì)胞的細(xì)胞,比如使用BD Vacutainer® CPT (Becton Dickinson)從全血或者脾中提取的淋巴細(xì)胞。但本試劑盒不適用于組織。
細(xì)胞凋亡產(chǎn)生的DNA片斷化受以下因素影響:靶細(xì)胞、誘導(dǎo)劑及其濃度和誘導(dǎo)的時(shí)間等。另外,最近有報(bào)道說(shuō)產(chǎn)生了細(xì)胞凋亡也可能沒(méi)有產(chǎn)生DNA片斷化。該問(wèn)題沒(méi)有確切的答案。根據(jù)本公司的經(jīng)驗(yàn),推薦使用1 mM星型胞菌素(Sigma,Code No. S4400)處理的HL60細(xì)胞作為驗(yàn)證提取成功的對(duì)照。
<使用HL60細(xì)胞實(shí)驗(yàn)例>
在90 mm培養(yǎng)皿中,加入10 ml培養(yǎng)基,接種107個(gè)HL60細(xì)胞,然后加入星型胞菌素,使其終濃度為3 μM。在37℃、5%CO2條件下培養(yǎng)5小時(shí)*,全量離心回收細(xì)胞。
用PBS(-) Buffer清洗一次后,使其懸浮于少量的PBS(-) Buffer中,將5×106個(gè)細(xì)胞移入1.5 ml Microtube中,1,600×g室溫離心5分鐘。得到的片斷化DNA最終用20 μl TE Buffer溶解。取其中5 μl用3% Agarose Gel電泳檢測(cè)。
*:細(xì)胞的不同培養(yǎng)狀態(tài)下星型胞菌素的作用效果也不同。圖1中的ladder是對(duì)星型胞菌素處理3~5小時(shí)得到的結(jié)果。
推薦使用3%的NuSieve® 3:1 Agarose (Lonza Rockland)。
頁(yè)面更新:2020-05-11 15:55:22