提取的total RNA量少,可以從以下幾個(gè)方面考慮:
· 使用的酵母菌體量過多。
使用多于2~5×107(使用Saccharomyces cerevisiae時(shí))的酵母菌體時(shí),Yeast Processing Enzyme Solution中含有的酶不能充分分解細(xì)胞壁,從而造成total RNA的提取量低。請使用適宜的酵母菌體量。依酵母(屬)不同能夠處理的適宜菌體數(shù)會(huì)有不同,此時(shí)請預(yù)先確認(rèn)適宜處理的菌體數(shù)量。
· 使用的酵母菌體量過少。
使用明顯少于2~5×107(使用Saccharomyces cerevisiae時(shí))的酵母菌體提取total RNA時(shí),total RNA的收量和純度會(huì)降低。為了能夠以穩(wěn)定的回收率回收total RNA,請使用上述記錄的菌體量相近的菌體提取total RNA。依酵母(屬)不同能夠處理的適宜菌體數(shù)會(huì)有不同,此時(shí)請預(yù)先確認(rèn)適宜處理的菌體數(shù)量。
· 所使用的酵母菌不適合使用該制品提取total RNA。
本制品使用Yeast Processing Enzyme Solution中含有的酶分解酵母細(xì)胞壁。因此,如果將該制品用于難于分解細(xì)胞壁的酵母菌時(shí),total RNA的提取量會(huì)顯著降低。
· total RNA的溶解不充分。
使用RNAiso Plus提取total RNA時(shí),75%乙醇清洗后,如果過度干燥會(huì)使溶解變得困難。因此請注意不要加熱干燥或長時(shí)間干燥。溶解困難時(shí),可在60℃加熱5分鐘后于冰上放置數(shù)小時(shí)溶解。
· 依據(jù)使用的酵母(屬)或培養(yǎng)條件,使用樣品的狀態(tài)(處于對數(shù)生長期的新鮮酵母菌體、長時(shí)間培養(yǎng)的酵母菌體、冷凍保存的酵母菌體pellet等)不同前處理的適宜時(shí)間不同。此時(shí)需要預(yù)先優(yōu)化處理時(shí)間。
· 以冷凍保存的酵母菌體pellet為樣品進(jìn)行提取時(shí),由于冷凍狀態(tài)和保存時(shí)間不同,可能對total RNA的質(zhì)量及純度產(chǎn)生影響。此時(shí),請準(zhǔn)備處于對數(shù)生長期的新鮮酵母菌體,不推薦長期冷凍保存的菌體。
使用NucleoSpin RNA提取total RNA時(shí),必須使用NucleoSpin RNA中添加Reaction Buffer for rDNase 和Reconstituted rDNase*在Column上進(jìn)行DNase I處理。(*參照NucleoSpin RNA的說明書進(jìn)行操作。)但是,即使是在Column上進(jìn)行DNase I 處理,由于被處理的酵母(屬)或培養(yǎng)條件,或被處理的酵母菌體是否過量及水相回收的情況等不同,可能依然會(huì)有基因組DNA混入。此種情況,請根據(jù)需要進(jìn)行DNase I處理,操作方法請參照說明書中Appendix內(nèi)容。
頁面更新:2019-04-26 16:24:29