ThruPLEX Plasma-Seq Kit是用于從血漿中純化的cell-free DNA起始合成Illumina公司NGS用的DNA文庫試劑盒。ThruPLEX Plasma-Seq Kit可以擴增高GC覆蓋的多樣性文庫,以1~30 ng的cell-free DNA起始即可得到再現(xiàn)性好的結(jié)果。
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ThruPLEX Plasma-Seq Kit是適用于血漿來源純化的Cell-free DNA的試劑盒。不需要Cell-free DNA的片段化,兩者的操作方法也不同(參照Q3)。
·模板制備過程:反應體積和反應溫度不同。
·文庫合成過程:反應體積和反應溫度不同。
·文庫擴增過程:反應體積和擴增循環(huán)數(shù)不同。
不可以。
可以使用QIAamp Circulating Nucleic Acid Kit(Qiagen公司、Code No.55114)制備cell-free DNA。
溶解起始DNA使用的緩沖液中的Tris及EDTA的濃度,注意分別不要超過10 mM和0.1 mM。不可以使用含有磷酸鹽的緩沖液。
Vacutainer Venous Blood Collection Tubes with K2 EDTA(Becton Dickinson公司、Code No. 36643)。
詳細流程請參考Plasma preparation for the ThruPLEX Plasma-Seq workflow。
血漿需要使用桌面離心機從血液中分離。制備好的血漿樣品,請于-80℃保存。
詳細流程請參考Plasma preparation for the ThruPLEX Plasma-Seq workflow。
ThruPLEX Plasma-Seq Kit適用于從血漿中分離得到的cell-free DNA,對于其他體液來源的降解DNA也有可能適用。使用血漿以外的其他樣品時,首先必須使用DNA提?。兓噭┖刑崛ell-free DNA。此類樣品來源的cell-free DNA通常已降解為DNA片段,因此不需要片段化處理。另外,需注意各反應中加入的cell-free DNA不能超過10 μl。
ThruPLEX Plasma-Seq Kit能夠與Agilent SureSelect、Roche NimbleGen SeqCap EZ等主要的exome和target富集產(chǎn)品組合使用。
頁面更新:2019-11-12 16:03:07