背靠《Nature》,揭秘SMART-Seq技術(shù)助攻:腫瘤細(xì)胞如何策反Treg細(xì)胞 |
提到腫瘤細(xì)胞和免疫細(xì)胞,一般我們想象的畫面是:英勇的T細(xì)胞像一個(gè)個(gè)戰(zhàn)士,在人體內(nèi)與腫瘤細(xì)胞斗智斗勇,以殺死腫瘤細(xì)胞保衛(wèi)身體為終極目標(biāo)。 所以按理說,腫瘤細(xì)胞和免疫細(xì)胞應(yīng)該永遠(yuǎn)是仇人般刀兵相見,勢不兩立。但是也正如武俠世界里總有那么幾個(gè)經(jīng)不住誘惑而轉(zhuǎn)身叛變的人。有這么一類免疫細(xì)胞,在狡猾的腫瘤細(xì)胞的糖衣炮彈攻擊下被成功策反,反過來幫助腫瘤細(xì)胞逃避免疫系統(tǒng)的“追殺”。 |
2021年2月15日,美國匹茲堡大學(xué)的Greg M. Delgoffe教授團(tuán)隊(duì)在Nature上發(fā)表題為:Metabolic support of tumor-infiltrating regulatory T cells by lactic acid 的文章,證實(shí)腫瘤細(xì)胞不僅能通過剝奪效應(yīng)T細(xì)胞的營養(yǎng)逃避“追殺”,還為“友軍”調(diào)節(jié)性T細(xì)胞(Treg細(xì)胞)提供乳酸來對抗效應(yīng)T細(xì)胞的殺傷作用。 |
文獻(xiàn)概要 |
研究表明,Treg細(xì)胞雖然對維持免疫穩(wěn)態(tài)至關(guān)重要,但因?yàn)?strong>腫瘤微環(huán)境(tumour microenvironment, TME)能夠促進(jìn)Treg細(xì)胞聚集、分化和激活,所以Treg細(xì)胞也是癌癥免疫的主要障礙。腫瘤細(xì)胞代謝紊亂促使一個(gè)代謝物耗竭、缺氧和酸性的TME形成,因此浸潤的效應(yīng)T細(xì)胞要與腫瘤細(xì)胞競爭代謝產(chǎn)物,并受到TME中Treg細(xì)胞的強(qiáng)烈抑制作用。之前的研究結(jié)果表明Treg細(xì)胞與效應(yīng)T細(xì)胞的代謝方式不同,所以作者猜想TME的代謝變化與Treg細(xì)胞活性增強(qiáng)相關(guān)。 研究發(fā)現(xiàn),Treg細(xì)胞代謝靈活,通常被認(rèn)為是糖酵解代謝副產(chǎn)物的乳酸,可以作為Treg細(xì)胞維持其高抑制能力的來源。阻止TME中Treg細(xì)胞攝取乳酸會(huì)減緩腫瘤生長并增加對免疫治療的反應(yīng)。 總的來說,Treg細(xì)胞能夠在TME中使用“替代”代謝物來維持其免疫抑制特性。此外,研究結(jié)果表明,腫瘤細(xì)胞通過剝奪效應(yīng)T細(xì)胞的營養(yǎng),并通過代謝支持Treg細(xì)胞群來避免被“破壞”。 |
涉及的Takara產(chǎn)品 |
在該項(xiàng)研究中,使用Takara產(chǎn)品SMART-Seq HT Kit(Code No. 634456)分別對純化的低糖親和力(2NBDGlow)和高糖親和力(2NBDGhigh)的Treg細(xì)胞亞群進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組分析,以進(jìn)一步了解不同葡萄糖親和力下Treg細(xì)胞的基因表達(dá)情況。 |
SMART-Seq HT Kit產(chǎn)品信息 |
★ 流程更加簡便,讓您在科研路上更快一步! |
SMART-Seq HT Kit是在經(jīng)典的SMART技術(shù)的基礎(chǔ)上進(jìn)行了優(yōu)化改良。搭載one-step RT-PCR技術(shù),4小時(shí)內(nèi)即可制備高品質(zhì)的全長cDNA! 而且它兼容自動(dòng)化移液工作站,采用oligo(dT)引物,支持1-100個(gè)細(xì)胞或10 pg-1 ng總RNA起始,可以更少的時(shí)間分析更多的樣本! |
★ 保留全長基因信息,性能依然卓越! |
SMART-Seq HT Kit保持了SMART技術(shù)一貫的高水準(zhǔn)的單細(xì)胞cDNA合成性能,不僅提供全長轉(zhuǎn)錄本的信息,還支持分析轉(zhuǎn)錄本異構(gòu)體、融合基因、點(diǎn)突變等內(nèi)容。同時(shí),價(jià)格更加親民,具有比較高的性價(jià)比! |
使用SMART-Seq v4試劑盒和SMART-Seq HT試劑盒從21個(gè)293T單細(xì)胞制備文庫,然后進(jìn)行測序分析。從上圖可以看出,SMART-Seq v4試劑盒和SMART-Seq HT試劑盒在基因表達(dá)分析中沒有顯著的偏差! |
新品推薦:SMART-Seq HT PLUS Kit(Code No. R400748) |
為了使單細(xì)胞cDNA合成、文庫構(gòu)建實(shí)驗(yàn)“一步”到位,我們?nèi)峦瞥隽?a href="http://grayarearadio.com/ProductShow.aspx?m=20190820132136950018&productID=20190820140119700087">SMART-Seq HT PLUS Kit。在包含核心的cDNA合成試劑基礎(chǔ)上,同時(shí)整合了Takara Bio Group專利性的文庫構(gòu)建技術(shù)(U.S. Patents 7,803,550, 8,399,199, 8,728,737, 9,598,727, 10,196,686, 10,208,337, and 11,072,823)及單次使用的雙端特殊index(UDI),提供完整的單細(xì)胞cDNA合成到文庫構(gòu)建的實(shí)驗(yàn)體驗(yàn)! |
★ 從高靈敏度、高重復(fù)性的cDNA合成出發(fā),構(gòu)建更高品質(zhì)Illumina文庫 |
數(shù)據(jù)來源于Takara Bio USA, Inc. |
Takara科學(xué)家從10 pg小鼠腦total RNA起始,采用SMART-Seq HT Kit完成cDNA合成。隨后分別使用SS-HT Plus Kit中的SMART-Seq Library Prep Kit模塊與市面上較常用的A公司試劑盒構(gòu)建文庫,并比較性能差異。測試數(shù)據(jù)中可以看出,SS-HT PLUS Kit所建文庫的產(chǎn)量是A公司Kit產(chǎn)量的5倍。并且SS-HT PLUS文庫能比A公司文庫多檢出10%的基因,從同樣的cDNA起始能“捕獲”更全的信息! |
頁面更新:2022-03-18 15:45:35