| 省流：上新品，有促銷，含UMI的單細(xì)胞RNA-Seq分析試劑盒！ | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 前言 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 什么是單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序？ | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序，簡(jiǎn)單來(lái)講，就是在單個(gè)細(xì)胞水平上，對(duì)轉(zhuǎn)錄組等遺傳信息進(jìn)行高通量測(cè)序分析的一項(xiàng)技術(shù)。與常規(guī)高通量測(cè)序相比，能夠在更精細(xì)的單個(gè)細(xì)胞水平上獲得遺產(chǎn)信息，從而揭示每個(gè)細(xì)胞的基因表達(dá)狀態(tài)。 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 單細(xì)胞mRNA-seq的挑戰(zhàn)是什么? | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 研究罕見或珍貴的樣本，比如神經(jīng)元細(xì)胞、干細(xì)胞、CTC等，需要非常高的靈敏度和再現(xiàn)性，因?yàn)閱蝹€(gè)細(xì)胞中RNA的含量十分有限（根據(jù)單個(gè)細(xì)胞的大小等情況不同，每個(gè)細(xì)胞可能只含有幾十皮克的RNA）。因此，生成沒有偏倚的mRNA-seq cDNA文庫(kù)是很具有挑戰(zhàn)性的一項(xiàng)工作。 創(chuàng)新研究不斷推動(dòng)新技術(shù)的邊界，以獲得引人注目的結(jié)果，而這其中仍然需要試劑、技術(shù)的支撐。在單細(xì)胞RNA-seq領(lǐng)域，Takara Bio提供的SMART技術(shù)，可以幫助研究人員進(jìn)一步突破RNA-seq靈敏度上限，提供高質(zhì)量的單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組分析結(jié)果。本次升級(jí)的產(chǎn)品SMART-Seq mRNA LP (with UMIs)，是整合UMI的單細(xì)胞/微量樣本的mRNA全長(zhǎng)分析建庫(kù)試劑盒。 |
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| 產(chǎn)品亮點(diǎn) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| · “高端”的技術(shù)萬(wàn)里挑一 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 基于Takara Bio的核心SMART技術(shù)(Switching Mechanism at 5' End of RNA Template)優(yōu)化改良，提供全長(zhǎng)轉(zhuǎn)錄本信息，可以高靈敏度在單細(xì)胞水平上分析差異表達(dá)、融合基因、可變剪接等。 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| · 加持的“標(biāo)簽”鼎力相助 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 通過(guò)逆轉(zhuǎn)錄步驟添加分子標(biāo)簽（UMIs），可以靈敏地識(shí)別PCR重復(fù)片段，并校正PCR擴(kuò)增錯(cuò)誤，從而獲得更高準(zhǔn)確性的基因或轉(zhuǎn)錄本檢測(cè)數(shù)。 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| · 連貫的文庫(kù)構(gòu)建流程 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 同時(shí)整合了Takara Bio專利性 的文庫(kù)構(gòu)建技術(shù)（U.S. Patents 7,803,550, 8,399,199, 8,728,737, 9,598,727, 10,196,686, 10,208,337, 和11,072,823），利用特別的莖環(huán)形接頭構(gòu)建高品質(zhì)Illumina文庫(kù)！另外，搭配使用Unique Dual Index Kits（單獨(dú)銷售），可以提供完整的從樣品到cDNA合成到文庫(kù)構(gòu)建的實(shí)驗(yàn)體驗(yàn)。同時(shí)搭配特別開發(fā)的Cogent NGS生物信息學(xué)分析軟件，能直接對(duì)下機(jī)數(shù)據(jù)進(jìn)行分析！ | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 性能展示 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| · 再現(xiàn)性測(cè)試數(shù)據(jù) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| 以10 pg K562 RNA以及3種不同起始量 (100 pg, 1 ng和10 ng)的 UHR RNA樣本起始，使用SMART-Seq mRNA LP (with UMIs)構(gòu)建測(cè)序文庫(kù)，均做3個(gè)重復(fù)。然后進(jìn)行測(cè)序，并使用CogentAP進(jìn)行分析。結(jié)果顯示，重復(fù)之間相關(guān)性系數(shù)非常高。即使起始量為10 pg時(shí)，也具有非常高的重現(xiàn)性！ | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| · 靈敏度測(cè)試數(shù)據(jù) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| 對(duì)36例核酸含量較低的PBMC樣本，使用SMART-Seq mRNA LP (with UMIs)制備文庫(kù)，并進(jìn)行測(cè)序分析。結(jié)果顯示，通過(guò)基因表達(dá)譜分析確認(rèn)了70%的PBMC是T細(xì)胞，這符合來(lái)自正常健康供體的PBMC預(yù)期比例。此外，還鑒定確認(rèn)一個(gè)B細(xì)胞、一個(gè)NK細(xì)胞，一個(gè)單核細(xì)胞和兩個(gè)樹突狀細(xì)胞，另有6個(gè)細(xì)胞無(wú)法明確類型。由此也說(shuō)明SMART-Seq mRNA LP (with UMIs)在單細(xì)胞水平的RNA-Seq分析上具有高靈敏度。 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| · 添加UMI校正偏差 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| 分別對(duì)10 pg RNA和單個(gè)細(xì)胞獲得的RNA樣本，摻入ERCC control RNA后進(jìn)行文庫(kù)制備，然后進(jìn)行測(cè)序分析。結(jié)果顯示，添加UMI后，決定系數(shù)R2值明顯提高，表明添加UMI降低PCR duplication，獲得更準(zhǔn)確的RNA counts。 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| · 兼容自動(dòng)化平臺(tái) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| SMART-Seq mRNA LP (with UMIs)兼容多種自動(dòng)化液體工作站進(jìn)行微縮化建庫(kù)。比如使用SMART-Seq mRNA LP (with UMIs)在Mantis Liquid Handler (Formulatrix)上將反應(yīng)體系體積微縮至1/2（HV），1/4（QV）以及在mosquito HV liquid handler (SPT Labs)上將反應(yīng)體系體積微縮至1/8，均能獲得與使用原反應(yīng)體系高度一致的結(jié)果。保證性能的同時(shí)，降低了成本和操作時(shí)間！ | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PS：另外還有兩款新品，也值得關(guān)注哦！ | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| · SMART-Seq® mRNA LP：少量細(xì)胞/微量樣本的mRNA-Seq文庫(kù)構(gòu)建試劑盒。它使用oligo(dT)引物起始，優(yōu)化用于從10 pg-100 ng的高品質(zhì)total RNA(RIN≥8)或1-1000個(gè)完整細(xì)胞起始，生成高質(zhì)量的測(cè)序文庫(kù)。 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| · SMART-Seq® mRNA ：少量細(xì)胞/微量樣本的cDNA合成試劑盒。它可以用于Ultra low RNA（10 pg-100 ng）或少量細(xì)胞（1-1000個(gè)完整細(xì)胞）cDNA合成的試劑盒，提供全長(zhǎng)轉(zhuǎn)錄本的信息。 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| 新品嘗鮮活動(dòng) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 看完心動(dòng)的您，剛好可以參加一下新品首發(fā)直降福利哦！ · 活動(dòng)時(shí)間：2022年11月29日-2022年12月23日 · 活動(dòng)品目及價(jià)格： |
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| 注：活動(dòng)期間，每位客戶僅限一次訂單有效。 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
頁(yè)面更新：2022-11-30 13:59:29
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