可靠的單細胞/微量樣本的mRNA全長分析 |
SMART-Seq mRNA LP & SMART-Seq mRNA |
· 高靈敏度 — 起始量:1-1000個細胞或10 pg-100 ng總RNA · 高質量的RNA-Seq數據 — 高基因檢出數,支持分析轉錄本異構體、融合基因、點突變等 · 單管操作流程 — SMART-Seq mRNA LP包含完整的cDNA合成和文庫構建流程,分別在單管中進行,減少樣品損失與混淆,降低手動操作誤差 · 增強的測序性能 — SMART-Seq mRNA LP可搭配整合雙端特殊index(UDI),構建Illumina測序文庫 · 完整的流程 — 搭配特別開發(fā)的Cogent™ NGS Analysis Pipeline (CogentAP) 和Cogent NGS Discovery Software (CogentDS)完成測序數據分析。 |
■ 產品說明: |
SMART-Seq mRNA LP和SMART-Seq mRNA,這兩個試劑盒是Takara經典的SMARTer Ultra low系列。它們都是使用oligo(dT)引物起始,優(yōu)化用于從10 pg-100 ng的高品質total RNA(RIN≥8)或1-1000個完整細胞的全長轉錄組分析。 SMART-Seq mRNA是基于SMART技術(Switching Mechanism at 5' End of RNA Template)優(yōu)化改良,用于微量RNA或少量細胞cDNA合成的試劑盒,提供全長轉錄本信息,支持分析轉錄本異構體、融合基因、點突變等。另外,TSO中整合了LNA(locked nucleic acid)技術,提升了模板轉換效率,能獲得更高的再現性、更均一的gene body覆蓋度,高GC含量轉錄本也能得到正確分析。 SMART-Seq mRNA LP在包含核心的cDNA合成試劑基礎上,采用Takara Bio Group專利性的文庫構建技術(U.S. Patents 7,803,550, 8,399,199, 8,728,737, 9,598,727, 10,196,686, 10,208,337, 和11,072,823),利用特別的莖環(huán)形接頭構建高品質Illumina文庫。另外,搭配使用的雙端特殊index(UDI),可以提供完整的從樣品到cDNA合成到文庫構建的實驗體驗。同時搭配特別開發(fā)的Cogent NGS生物信息學分析軟件,能直接對下機數據進行分析(*科研及盈利機構在用該試劑盒建庫后,均可免費使用Cogent NGS分析測序數據!) 如果對上述特點感興趣,并正在使用完整的、高質量的單細胞,推薦使用SMART-Seq mRNA Single Cell。 如果是降解樣本,選擇隨機引物起始,推薦使用:SMART-Seq® Total RNA Single Cell (ZapR™ Mammalian)。 |
■ 流程概要: |
注意:SMART-Seq mRNA LP和SMART-Seq mRNA是SMART-Seq v4 PLUS和SMART-Seq v4 Ultra Low Input RNA Kit for Sequencing的等效替代品,只有如下細微變動,本次更新并不影響這些試劑盒的流程和性能。 |
· SeqAmp CB PCR buffer替代SeqAmp PCR buffer,以改善核酸純化過程磁珠-沉淀物形成。 · 不再包含Afa I, 10X Afa I Buffer和0.1% BSA(因為在protocol中未使用) · 樣本的起始范圍從10 pg~10 ng擴展到10 pg~100 ng total RNA · 更靈活的選擇:SMART-Seq mRNA LP試劑盒中不包含index,但也可以與Unique Dual Index (UDI) kits搭配使用 |
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頁面更新:2024-08-21 15:50:27