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酵母雜交系統(tǒng)是利用酵母轉(zhuǎn)錄因子GAL4的特性來進行蛋白質(zhì)相互作用分析的系統(tǒng)。 在酵母雙雜交系統(tǒng)中,GAL4 DNA -BD (DNA 結(jié)合域)與bait(誘餌)融合表達,GAL4 AD (轉(zhuǎn)錄激活域)與prey(獵物:文庫))融合表達。bait和prey之間的相互作用可以使GAL4重新具有轉(zhuǎn)錄活性,從而可以激活下游報告基因的表達。利用選擇培養(yǎng)基進行篩選即可獲得具有報告基因活性的克隆,從而分析蛋白質(zhì)之間的相互作用。在酵母單雜交系統(tǒng)中,GAL4 AD與prey蛋白質(zhì)融合表達,prey與bait DNA序列(目的DNA序列)之間的相互作用可以激活下游報告基因的表達,從而使宿主酵母可以在缺陷培養(yǎng)基上生長。 而轉(zhuǎn)化,無疑是實驗中至關重要的一步,只有成功轉(zhuǎn)化才能繼續(xù)進行接下來的相關基因表達以及互作。 |
今天來介紹一下實驗中“有大用”的酵母轉(zhuǎn)化試劑盒! |
酵母轉(zhuǎn)化試劑盒Yeastmaker Yeast Transformation System 2 (Code No. 630439) |
本試劑盒采用聚乙二醇(PEG)/醋酸鋰方法高效制備并轉(zhuǎn)化酵母感受態(tài)菌株,適用于小規(guī)?;蛭膸旒墑e的高效酵母轉(zhuǎn)化,轉(zhuǎn)化效率為3 × 105轉(zhuǎn)化子/μg質(zhì)粒DNA。 |
兩大優(yōu)點,提高轉(zhuǎn)化效率! |
♦ 采用“YPD Plus”復蘇培養(yǎng)基,使更多的克隆子得以存活,為轉(zhuǎn)化過程提供了更加高效、可靠的方法。 ♦ 優(yōu)化的Yeastmaker Carrier DNA(鮭魚精子DNA)有助于質(zhì)粒DNA的吸收。 |
海量應用案例,助力每一次酵母轉(zhuǎn)化實驗: |
1、酵母雙雜交系統(tǒng),構(gòu)建bait/prey蛋白質(zhì),用于研究蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)的相互作用。 Qu, Y., Wang, X., et al. (2021). ORF3a-Mediated Incomplete Autophagy Facilitates Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus-2 Replication. Frontiers in cell and developmental biology, 9, 716208. 通過篩選SARS-CoV-2(嚴重急性呼吸綜合征冠狀病毒-2,2019年冠狀病毒病(新冠肺炎)大流行的病原體)的26種病毒蛋白,證明僅ORF3a的表達足以誘導不完全自噬。 以SARS-CoV-2 ORF3a作為誘餌蛋白質(zhì)進行酵母雙雜交篩選(使用Yeastmaker Yeast Transformation System 2將誘餌蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)化至酵母菌株Y187),發(fā)現(xiàn)了 UVRAG與SARS-CoV-2 ORF3a的新的蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用,UVRAG是激活PI3KC3復合物以促進自噬體成熟并抑制人類結(jié)腸癌細胞增殖的關鍵自噬調(diào)節(jié)劑。通過SARS-CoV-2 ORF3a與自噬調(diào)節(jié)因子UVRAG相互作用,進一步研究ORF3a宿主自噬機制以及促進SARS-CoV-2復制的機制。 |
2、重組酵母菌株,用于研究重組酵母菌株相關性能 Suzuki, T., Hoshino, T. et al. (2019). High-temperature ethanol production by a series of recombinant xylose-fermenting Kluyveromyces marxianus strains. Enzyme and microbial technology, 129, 109359. 通過構(gòu)建了兩個重組馬克思克魯維菌株DMB5和DMB13,用于研究表達木糖還原酶(XR)、NAD+或NADP+依賴性木糖醇脫氫酶(XDH)和木糖醇激酶(XK)。使用Yeastmaker Yeast Transformation System 2對質(zhì)粒pGK406-XDHXKXR和pGK606-mXDHXXXR進行酵母轉(zhuǎn)化,轉(zhuǎn)化為馬克思克魯維酵母酵母DMB2-108,并稍加修改。用EcoRV消化基于pGK406的質(zhì)粒(pGK406 XDHXXKXR和pGK406 mXDHXXR),然后用于轉(zhuǎn)化到DMB2-108中,分別構(gòu)建重組菌株DMB5和DMB13。質(zhì)粒pGK406用EcoR V消化,然后轉(zhuǎn)化到DMB2-108中以構(gòu)建DMB4(對照菌株)。將這些菌株與先前報道的表達木糖發(fā)酵酵母(Scheffersomyces stipitis)XR和NAD+依賴性XDH以及釀酒酵母XK的菌株DMB3-7進行比較,以評估30°C和40°C下的酶活性和乙醇生產(chǎn)率。 |
3、構(gòu)建酵母載體,進行酵母表達研究 a) Thimmappa, R., Wang, S.,et al. (2022). Biosynthesis of saponin defensive compounds in sea cucumbers. Nature chemical biology, 18(7), 774–781. 釀酒酵母是功能分析基因的模式生物,酵母系統(tǒng)已被廣泛用于確認幾種植物中脂肪酸去飽和酶的預測活性。將空pYES2載體轉(zhuǎn)化的酵母細胞用作對照;酵母表達載體pYES2被用于獨立克隆BnaFAD2-A5和BnaFAE1-A8基因,將兩個構(gòu)建體分別轉(zhuǎn)化(使用Yeastmaker Yeast Transformation System 2)到釀酒酵母(INVSc1)中,并在酵母中表達它們以評估其功能。 b) Zafar, S., Tang, M. et al. (2020). Candidate genes-association study to identify loci related to oleic acid in Brassica napus using SNP markers and their heterologous expression in yeast. Plant physiology and biochemistry : PPB, 146, 294–302. 通過整合DNA技術,將紫球海膽(S.purpuratus)LSS、仿刺參(A.japonicus)的OSC1a、OSC2a、OSC1b和OSC2b編碼序列合成為gBlocks。然后在酵母中通過同源重組方式重組gBlocks以獲得全長基因。在酵母菌株Gil77(gal2 hem3-6 erg7 ura3-167)中進行所有酵母同源重組和表達分析。使用引物通過PCR擴增gBlocks。然后將擴增的gBlocks與用Xba I和Hind III線性化的pYES2載體一起共轉(zhuǎn)化為Gil77。使用Yeastmaker Yeast Transformation System 2進行酵母轉(zhuǎn)化。轉(zhuǎn)化使pYES2載體和gBlock OSC片段之間的體內(nèi)重組,從而產(chǎn)生全長表達構(gòu)建體。從酵母中回收質(zhì)粒并轉(zhuǎn)化到大腸桿菌(DH5α)中,通過測序驗證其序列并進行后續(xù)酵母表達相關研究。 |
多種關聯(lián)好物,強烈推薦! |
♦ Matchmaker Gold酵母雙雜交系統(tǒng)是深受歡迎的Matchmaker產(chǎn)品線中研究蛋白質(zhì)—蛋白質(zhì)相互作用的一款產(chǎn)品。系統(tǒng)中包含新的Y2HGold酵母菌株、更加嚴密的篩選報告基因、簡單易用的文庫、高水平表達的載體以及基于SMART技術的文庫構(gòu)建試劑盒。 ♦ Matchmaker Gold酵母單雜交(Y1H)文庫篩選系統(tǒng)為鑒定蛋白質(zhì)-DNA相互作用提供了簡便高效的方法。所有的Matchmaker Gold系統(tǒng)均采用篩選強度較高的Aureobasidin A(AbAr)抗生素報告基因。這種新型的報告子可以高效殺死非抗性克隆,從而大大降低了背景克隆的生長。 ♦ Make Your Own Mate & Plate Library System可以用于自制文庫。利用該系統(tǒng),一周之內(nèi)即可構(gòu)建足夠用于數(shù)百次酵母雙雜交篩選實驗的所需文庫。文庫構(gòu)建是在Y187文庫酵母菌株中通過酵母高效的同源重組機制直接完成的,無需進行傳統(tǒng)文庫構(gòu)建過程中的一些繁冗的操作 (比如文庫克隆、擴增和大腸桿菌收集等)。 ♦ Normalized Mate and Plate Libraries是高度復雜的cDNA文庫,文庫克隆到GAL4 AD載體上并轉(zhuǎn)化到酵母菌株Y187中。因為文庫擴增和酵母轉(zhuǎn)化操作已經(jīng)完成,所以使用這些文庫進行雙雜交篩選更加省時省力。均一化處理降低了文庫中高豐度的轉(zhuǎn)錄本,低豐度及稀少的cDNA得以富集,這樣的文庫更加具有基因代表性,也使篩選操作更加簡單,并大大降低了在篩選文庫時獲得假陽性的可能性。 |
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頁面更新:2023-10-18 11:46:17