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■ 制品內(nèi)容 (20 次量) |
制品內(nèi)容1~9項(xiàng)為用于3’RACE實(shí)驗(yàn)的反轉(zhuǎn)錄用試劑,可用于20次反轉(zhuǎn)錄反應(yīng) (約100次3’RACE PCR反應(yīng));10~12為Control實(shí)驗(yàn)用試劑,可進(jìn)行5次Control實(shí)驗(yàn)。 |
1. PrimeScript RTase (200 U/μl) |
10 μl |
2. RNase Inhibitor(40 U/μl) |
10 μl |
3. 5 × PrimeScript Buffer |
40 μl |
4. dNTP Mixture (10 mM each) |
20 μl |
5. 3’RACE Adaptor (5 μM) |
20 μl |
6. RNase Free dH2O |
1 ml |
7. 1 × cDNA Dilution Buffer II |
1 ml |
8. 3’RACE Outer Primer (10 μM ) |
200 μl |
9. 3’RACE Inner Primer (10 μM ) |
200 μl |
10. Control HL60 Total RNA (500 ng/μl)* |
10 μl |
11. 3’RACE Control Outer Primer (10 μM)* |
10 μl |
12. 3’RACE Control Inner Primer (10 μM)* |
10 μl |
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* 用于擴(kuò)增Human Prohibitin (PHB) 基因。 |
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■ 制品說(shuō)明 |
本試劑盒是高靈敏度、高特異性擴(kuò)增cDNA 3’末端全長(zhǎng)的試劑盒。對(duì)RNA結(jié)構(gòu)進(jìn)行分析時(shí),一般先通過(guò)RT-PCR反應(yīng)擴(kuò)增目的區(qū)域,然后再對(duì)擴(kuò)增出的目的DNA片段進(jìn)行克隆、序列分析等。一般的RT-PCR反應(yīng)很難得到全長(zhǎng)的cDNA片段,然而在基因工程研究中,分析遺傳基因的全長(zhǎng)cDNA序列又是十分重要的。RACE (Rapid Amplification of cDNA Ends) 法能有效地解決這一問(wèn)題。3’-Full RACE Core Set with PrimeScript RTase能夠通過(guò)已知的cDNA序列,高靈敏度、高特異性地?cái)U(kuò)增cDNA的3’末端的全長(zhǎng)序列。
本試劑盒中含有完成3’-RACE操作的主要試劑。試劑盒中使用的PrimeScript Reverse Transcriptase經(jīng)過(guò)了本公司的特殊改良,反轉(zhuǎn)錄性能良好,無(wú)RNase H活性,大大增加了反轉(zhuǎn)錄性能。結(jié)合使用TaKaRa LA Taq (Code No.: RR002A) 進(jìn)行PCR擴(kuò)增時(shí),其3’RACE的擴(kuò)增性能大大優(yōu)于其他同類產(chǎn)品。
本試劑盒應(yīng)用了套式PCR原理,增加了PCR擴(kuò)增的特異性與靈敏度,可以對(duì)少量樣品或低豐度的基因進(jìn)行3’RACE實(shí)驗(yàn),并且對(duì)長(zhǎng)片段的3’RACE擴(kuò)增具有明顯優(yōu)勢(shì),我們?cè)?jīng)使用本試劑盒成功擴(kuò)增了8 kb的3’RACE DNA片段。使用TaKaRa LA Taq™ 擴(kuò)增得到的PCR產(chǎn)物3’端附有一個(gè)“A” 堿基,其產(chǎn)物可直接克隆于T-Vector中。反轉(zhuǎn)錄引物3’RACE Adaptor Primer含有由Takara特別設(shè)計(jì)的dT區(qū)域,反轉(zhuǎn)錄效率高。3’RACE Inner Primer中含有BamH I酶切位點(diǎn),為克隆實(shí)驗(yàn)提供了方便。制品中的Control RNA及Control Primer可以用于Control實(shí)驗(yàn)。
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■ 各種引物的序列 |
引物名稱 |
引物序列 (5’→3’) |
3’RACE Adaptor |
含有由Takara特別設(shè)計(jì)的dT區(qū)域及Adaptor Primer部分 |
3’RACE Outer Primer |
TACCGTCGTTCCACTAGTGATTT |
3’RACE Inner Primer |
CGCGGATCCTCCACTAGTGATTTCACTATAGG |
3’RACE Control Outer Primer |
GAGTGCAGGACATTGTGGTAGGG |
3’RACE Control Inner Primer |
ATCTTTGACTGCCGTTCTCGACC |
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■ 試劑盒原理 |
進(jìn)行3’RACE 實(shí)驗(yàn)時(shí),首先由PrimeScript Reverse Transcriptase將Poly(A)+RNA反轉(zhuǎn)錄成cDNA,然后再使用TaKaRa LA Taq (Code No.: RR002A),以反轉(zhuǎn)錄的cDNA為模板,進(jìn)行套式PCR反應(yīng)。3’RACE Adaptor Primer作為反轉(zhuǎn)錄引物用于cDNA合成 (具體原理見(jiàn)圖1)。 |
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圖1. 3’-Full RACE Core Set with PrimeScript RTase的實(shí)驗(yàn)原理圖 |
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1. 以Total RNA為模板,使用3’RACE Adaptor引物進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄反應(yīng),合成1st Strand cDNA。
2. 使用上游外側(cè)特異性引物 (GSP1) 和3’RACE Outer Primer進(jìn)行1st PCR反應(yīng)。如果1st PCR反應(yīng)未能得到目的產(chǎn)物,再使用上游內(nèi)側(cè)特異性引物 (GSP2) 和3’RACE Inner Primer進(jìn)行2nd PCR反應(yīng)。
3. PCR產(chǎn)物可以直接進(jìn)行DNA測(cè)序或TA克隆。如果使用含有BamH I酶切位點(diǎn)的上游內(nèi)側(cè)特異性引物進(jìn)行2nd PCR擴(kuò)增時(shí),可以使用限制酶 (BamH I) 對(duì)PCR產(chǎn)物進(jìn)行酶切反應(yīng),然后克隆至相關(guān)的載體中。 |
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■ 注意事項(xiàng) |
1. 同時(shí)需要進(jìn)行數(shù)次反轉(zhuǎn)錄反應(yīng)或PCR反應(yīng)時(shí),應(yīng)先配制各種試劑的混合液 (Master Mix;其中包括RNase Free dH2O、Buffer、dNTP Mixture等),然后再分裝到每個(gè)反應(yīng)管中。這樣,可使所取的試劑體積更準(zhǔn)確,減少試劑損失,避免重復(fù)分取同一試劑。同時(shí)也可以減少實(shí)驗(yàn)操作或?qū)嶒?yàn)之間產(chǎn)生的誤差。
2. 使用PrimeScript Reverse Transcriptase、RNase Inhibitor等酶類時(shí),應(yīng)輕輕混勻,避免起泡,分取之前要小心地離心收集到反應(yīng)管底部。由于酶保存液中含有50%的甘油,粘度高,分取時(shí)應(yīng)慢慢吸取。
3. 酶制品應(yīng)在實(shí)驗(yàn)前才從-20℃中取出,使用后也應(yīng)立即放回-20℃中保存。
4. 為了防止Control RNA分解,應(yīng)盡量避免反復(fù)凍融。有條件的實(shí)驗(yàn)室建議保存于-70℃至-80℃。
5. 分裝試劑時(shí)務(wù)必使用新的槍頭 (Tip),以防止樣品間污染。 |
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