PrimeCap T7 RNA Polymerase(low dsRNA)是改良的T7 RNA聚合酶*,兼具Cap類似物依賴性RNA合成、低dsRNA生成和耐熱性(~52℃)的特點。使用了本酶和Cap類似物的體外轉(zhuǎn)錄 (IVT),可大量制備具有高加帽效率的高質(zhì)量mRNA,同時大幅減少具有免疫原性dsRNA的生成。因此,本制品適用于疫苗等RNA醫(yī)藥領(lǐng)域的研發(fā)。 |
*以T7啟動子序列為模板,NTP為底物的雙鏈DNA,通過轉(zhuǎn)錄啟動子下游區(qū)域,在體外合成單鏈RNA的酶。 |
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典型的T7啟動子序列和轉(zhuǎn)錄起始點(使用 CleanCap Reagent AG(TriLink公司)時的注意事項)
用于制備IVT反應(yīng)的模板DNA的典型T7啟動子序列如下所示。需要根據(jù)要合成的RNA序列和用于5'-cap修飾的Cap類似物的特性來設(shè)計模板,因此,請根據(jù)實驗?zāi)康臏?zhǔn)備模板DNA。
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[使用CleanCap Reagent AG時]
建議轉(zhuǎn)錄起點(+1 位置)的 NGG 序列為 AGG
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[合成未加帽的RNA時]
建議轉(zhuǎn)錄起點(+1 位置)的 NGG 序列為 AGG或GGG
[使用ARCA時]
建議轉(zhuǎn)錄起點 (+1位置)的 NGG 序列為 GGG
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圖1. FLuc mRNA合成產(chǎn)量(約1.9 kb)(左圖)、抑制dsRNA產(chǎn)生效果(中圖)和dsRNA含量(右圖) |
以Takara IVTpro T7 mRNA合成試劑盒(Code No. 6144)的組分中的陽性對照(FLuc)作為模板,分別使用T7 RNA Polymerase ver.2.0(Code No. 2541A)和PrimeCap™ T7 RNA Polymerase (low dsRNA)(Code No. 2560A)來合成mRNA,體系為20 μl 反應(yīng),參考使用例。比較37℃下的IVT反應(yīng)結(jié)果時,使用2560A合成mRNA時產(chǎn)生的副產(chǎn)物dsRNA,與2541A相比可以降低到10%甚至更低,且不會影響mRNA的合成產(chǎn)量。 |
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圖2. 不同Cap類似物濃度的mRNA產(chǎn)量(左上)、加帽效率(右上)和蛋白質(zhì)表達水平(左下)的比較 |
以Positive Control Template (FLuc)為模板,使用PrimeCap™ T7 RNA Polymerase (low dsRNA)(Code No. 2560A)或T7 RNA Polymerase ver.2.0(Code No. 2541A)與不同濃度(0、2、4、6、8 mM)的CleanCap Reagent AG(TriLink)進行IVT反應(yīng)合成FLuc mRNA(約1.9 kb),并測定mRNA產(chǎn)量(左上圖)。通過LC/MS測定合成的mRNA的加帽效率(右上圖)。 此外,將合成的FLuc mRNA轉(zhuǎn)染到HEK293細胞中,通過FLuc法評估細胞中的蛋白質(zhì)表達水平(左下圖)。mRNA的產(chǎn)量隨著CleanCap Reagent AG的濃度而增加(左上圖),即使使用低濃度的CleanCap Reagent AG,也顯示了其高加帽效率(右上圖)。此外,用該產(chǎn)品合成的mRNA在所有CleanCap Reagent AG濃度下都具有高蛋白質(zhì)表達水平(左下圖)。 |
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■ 保存 |
-20℃ |
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■ 起源 |
Escherichia coli carrying a plasmid containing the gene for phage T7 RNA polymerase variant. |
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■ 性質(zhì) |
1. 分子量:約99.8 kDa
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輔因子:Mg2+ |
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■ 活性定義 |
在 37℃,1 小時內(nèi)使 1 nmol [3H] GMP 摻入酸不溶性沉淀物所需要的酶量定義為1個活性單位(U)。 |
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■ 用途 |
1. 使用Cap類似物合成帶帽的mRNA(共轉(zhuǎn)錄加帽)
2. 用于酶法加帽的無帽RNA的合成
※ 與使用Cap類似物時相比,RNA產(chǎn)量減少10%~40%。
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■ 使用注意 |
1. 酶不要劇烈攪拌。
2. 當(dāng)dsDNA模板、試劑、試管或微量移液器吸頭被RNase污染時,合成的RNA產(chǎn)量會降低或者出現(xiàn)片段化。在實驗過程中應(yīng)采取預(yù)防措施以避免RNase污染,例如戴一次性手套和使用專門用于 RNA實驗的試管和微量移液器吸頭。
3. 為了合成長度一致的RNA,通常使用線性dsDNA(例如線性化質(zhì)粒和PCR產(chǎn)物)用于體外轉(zhuǎn)錄。我們建議模板DNA末端應(yīng)為5’-突出或平端,以避免出現(xiàn)非特異性產(chǎn)物??筛鶕?jù)具體情況,使用BspQ I等限制酶使模板DNA線性化。
4. 緩沖液中的亞精胺會與核酸形成復(fù)合物并可能產(chǎn)生沉淀,因此模板DNA應(yīng)在加酶之前即倒數(shù)第二步再加入反應(yīng)體系中。
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