SMARTer Human TCR a/b Profiling Kit—
獲得TCR-α和TCR-β鏈V(D)J可變區(qū)全長(zhǎng)序列 |
· 完整的 V(D)J序列信息—獲得TCR mRNA轉(zhuǎn)錄本可變區(qū)全長(zhǎng)序列
· TCR-alpha 和 TCR-beta—分析TCR2個(gè)亞基的多樣性,無(wú)論是同一實(shí)驗(yàn)還是單獨(dú)實(shí)驗(yàn)
· 起始樣品靈活—可以10 ng-3 μg 外周血RNA或50-10,000個(gè)純化T細(xì)胞起始
· 無(wú)需多重PCR—每次反應(yīng)利用一對(duì)引物擴(kuò)增相應(yīng)的TCR亞基
· Illumina-ready 測(cè)序文庫(kù)—無(wú)需接頭連接即可添加Illumina接頭和index序列
· 靈敏度高—即使是測(cè)序深度很低的情況下也可檢測(cè)低豐度TCR序列
· 出色的重復(fù)性—在不同起始量情況下可以獲得一致性很好的結(jié)果 |
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SMARTer Human TCR a/b Profiling Kit給需要開(kāi)展T細(xì)胞受體(TCR)NGS分析的研究者提供了一種新的強(qiáng)大的解決方案。試劑盒采用類(lèi)似于5’RACE的方法,可以人血液RNA(10 ng-3 μg)或完整淋巴細(xì)胞(50-10,000 個(gè)純化T細(xì)胞)起始,捕獲TCR V(D)J完整可變區(qū)域。顧名思義,本試劑可以在同一實(shí)驗(yàn)或單獨(dú)實(shí)驗(yàn)中獲得TCR-alpha和TCR-beta鏈多樣性數(shù)據(jù)。與采用多重PCR方法研究TCR多樣性不同,每輪文庫(kù)擴(kuò)增只使用針對(duì)不同TCR亞基的一個(gè)引物對(duì)擴(kuò)增。構(gòu)建的文庫(kù)添加了index序列可用于Illumina®測(cè)序平臺(tái)測(cè)序。
試劑采用了SMART (Switching Mechanism at 5’ End of RNA Template)技術(shù)和LNA技術(shù),可以無(wú)偏擴(kuò)增TCR mRNA序列,并具有很高的靈敏度。 |
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圖1. SMARTer 法文庫(kù)構(gòu)建流程及TCR多樣性分析PCR策略 |
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Technote:
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SMART human TCR-Seq:
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