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單細(xì)胞mRNA全長(zhǎng)分析SMART-Seq Single Cell Kit
品牌	Code No.	產(chǎn)品名稱	包裝量	價(jià)格（元）	說(shuō)明書(shū)	數(shù)量
Clontech	634470	SMART-Seq Single Cell Kit(庫(kù)存銷售完畢即終賣)	12 Rxns	￥13,875
Clontech	634471	SMART-Seq Single Cell Kit	48 Rxns	￥39,269

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SMART-Seq Single Cell Kit & SMART-Seq Single Cell Plus Kit：更勝一籌的單細(xì)胞mRNA全長(zhǎng)分析

· 簡(jiǎn)便，基于Plate的工作流程 - 可直接以FACS或其他方法分選的單細(xì)胞起始
· 單管操作流程 - SMART-Seq Single Cell PLUS Kit包含完整的cDNA合成和文庫(kù)構(gòu)建流程，分別在單管中進(jìn)行，減少樣品損失與混淆，降低手動(dòng)操作誤差
· 靈敏度高和一致性好 - 非常適用于單細(xì)胞（尤其是RNA含量非常低的細(xì)胞和細(xì)胞核）RNA-Seq的研究，可檢測(cè)更多基因
· 可靠的全長(zhǎng)cDNA分析 - 性能優(yōu)于許多現(xiàn)有的單細(xì)胞全長(zhǎng)cDNA合成方法，例如Smart-seq2
· 增強(qiáng)的測(cè)序性能 - SMART-Seq Single Cell PLUS Kit整合雙端特殊index（UDI），即便多個(gè)文庫(kù)pool后用高通量型Illumina測(cè)序儀（如Novaseq）分析，也能得到正確結(jié)果
· 高度靈活的工作流程 - 可與自動(dòng)化設(shè)備兼容
· 更高的文庫(kù)產(chǎn)量 - 更便于使用高通量型Illumina測(cè)序儀分析（如Novaseq），或保存剩余的文庫(kù)用于多次測(cè)序

注意: SMART-Seq mRNA Single Cell是SMART-Seq Single Cell Kit (SSsc)的等效替代品，本次更新并不影響這些試劑盒的流程和性能。

■ 產(chǎn)品說(shuō)明

SMART-Seq Single Cell Kit (SSsc) 和SMART-Seq Single Cell PLUS Kit (SSsc PLUS) 是Takara科學(xué)家專門(mén)研發(fā)推出的兩款具有高靈敏度和高可再現(xiàn)性的試劑盒，適用于單細(xì)胞和單個(gè)細(xì)胞核的RNA-Seq分析。試劑盒采用oligo（dT）引物，可從一些RNA含量非常低的單細(xì)胞（如PBMC, T細(xì)胞，B細(xì)胞）直接起始，并完成全長(zhǎng)cDNA的捕獲。

SMART-Seq Single Cell Kit是基于經(jīng)典的SMART技術(shù)優(yōu)化改良而來(lái)的單細(xì)胞cDNA合成試劑盒，可以提供全長(zhǎng)轉(zhuǎn)錄本的信息，支持分析轉(zhuǎn)錄本異構(gòu)體、融合基因、點(diǎn)突變等廣受科研人員關(guān)注的研究?jī)?nèi)容，具有更高的靈敏度和再現(xiàn)性。此外，該試劑盒還能提供均一的gene body覆蓋度，高GC含量轉(zhuǎn)錄本也能得到正確分析。這些改進(jìn)使得SSsc更適合單細(xì)胞分析，能得到更多有效reads、更高的基因檢測(cè)數(shù)，對(duì)珍貴樣本的理解更透徹！這些特點(diǎn)使SSsc遠(yuǎn)遠(yuǎn)超過(guò)許多現(xiàn)有的單細(xì)胞全長(zhǎng)cDNA合成方法，例如SMART-Seq2！

SMART-Seq Single Cell PLUS Kit在包含核心的cDNA合成試劑基礎(chǔ)上，同時(shí)整合了Takara Bio Group專利性的文庫(kù)構(gòu)建技術(shù)（U.S. Patents 7,803,550, 8,399,199, 8,728,737, 9,598,727, 10,196,686, 10,208,337, and 11,072,823）及單次使用的雙端特殊index（UDI），提供完整的單細(xì)胞cDNA合成到文庫(kù)構(gòu)建的實(shí)驗(yàn)體驗(yàn)。建庫(kù)試劑中包含片段化酶，以實(shí)現(xiàn)對(duì)合成cDNA的片段化，接著利用特別的莖環(huán)形接頭構(gòu)建高品質(zhì)Illumina文庫(kù)。在建庫(kù)階段，單管兩步操作、過(guò)程中無(wú)需純化、2 h即可建成文庫(kù)！

■ SSsc：更勝一籌的單細(xì)胞全長(zhǎng)轉(zhuǎn)錄組分析！

The SMART-Seq Single Cell Kit outperforms Smart-seq2

圖1. 與Smart-seq2法的比較

Takara科學(xué)家以淋巴母細(xì)胞系GM12878單細(xì)胞為樣本制備文庫(kù)，分別采用SMART-Seq Single Cell Kit(SSsc,18個(gè)重復(fù))和Smart-seq2法（Smart-seq2，20個(gè)重復(fù)）合成cDNA（均進(jìn)行19個(gè)PCR循環(huán)擴(kuò)增），所有樣本都均一化至1.75M paired-end reads，然后制備RNA-Seq文庫(kù)并進(jìn)行測(cè)序分析。

Panel A 根據(jù)cDNA的制備方法不同，結(jié)果也不同。相比而言，Smart-seq2結(jié)果中比對(duì)到線粒體基因組的比率較高，而檢測(cè)到基因鑒別的reads數(shù)相對(duì)較少。

Panel B SMART-Seq Single Cell Kit能檢測(cè)到比Smart-seq2更多的基因。

■ SSsc PLUS Kit：不只是一個(gè)Kit，更是完整且更勝一籌的單細(xì)胞RNA-Seq建庫(kù)體驗(yàn)！

為了使單細(xì)胞cDNA合成、文庫(kù)構(gòu)建實(shí)驗(yàn)“一步”到位，我們?nèi)峦瞥隽薙Ssc PLUS Kit，從此您無(wú)需再單獨(dú)購(gòu)買建庫(kù)模塊，也不用“忍受”不同廠家不同步的供貨周期。

從高靈敏度、高重復(fù)性的cDNA合成出發(fā)，構(gòu)建更高品質(zhì)Illumina文庫(kù)

Takara科學(xué)家以10 pg小鼠腦total RNA起始，采用SMART-Seq Single Cell Kit完成cDNA合成。隨后分別采用SSsc Plus Kit中的SMART-Seq Library Prep Kit模塊與市面上較常用的A公司試劑盒構(gòu)建文庫(kù)，并比較性能差異。

從測(cè)試數(shù)據(jù)中可以看出，SSsc PLUS Kit所建文庫(kù)的產(chǎn)量是A公司Kit產(chǎn)量的5倍，而更高的文庫(kù)產(chǎn)量更適于高通量型Illumina測(cè)序儀，如Novaseq。

兩種方法所建文庫(kù)隨后用Nextseq 500完成測(cè)序，并對(duì)TPM(Transcripts per million)≥0.1的基因數(shù)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)。相較于A公司文庫(kù)，SSsc PLUS文庫(kù)能檢出更多的基因，從同樣的cDNA起始能“捕獲”更全的信息！