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■ 海報資源
 
Takara Bio R&D團隊定期參加各種學術(shù)會議,為各種科學的討論貢獻我們的力量。點擊閱讀以下海報資源,了解Takara Bio如何不斷推進單細胞研究。
 
利用SMART技術(shù)進行高通量單細胞TCR分析
High-throughput single-cell T-cell receptor profiling by SMART technology
 
內(nèi)容簡介:
單細胞TCR克隆型分析可以完成對每一個細胞所表達的特異性α-β受體鏈配對信息的測定。受體鏈配對信息能夠幫助研究人員深入了解T細胞異質(zhì)性和可塑性,有助于確定配對信息對單個細胞TCR抗原特異性的影響,對治療性抗體的設(shè)計起到輔助作用。海報中案例采用類似5’RACE的方法和SMART技術(shù),基于96孔板和ICELL8 Single-Cell System自動化單細胞系統(tǒng)兩種方式,對單細胞TCR可變區(qū)全長進行了捕獲建庫,并對分析數(shù)據(jù)進行了展示。
 
利用ICELL8系統(tǒng)進行單細胞全長轉(zhuǎn)錄組分析數(shù)據(jù)展示
High-throughput single-cell RNA-, DNA-, and ATAC-seq
 
內(nèi)容簡介:
對于檢測單細胞并解決細胞亞群問題(如,與耐藥、細胞更新相關(guān)的亞群)的渴望,總是與單細胞分離技術(shù)的改進相伴而行。同時,對自動化單細胞處理系統(tǒng)的需求也從未停止,研究人員希望無論什么類型或尺寸的細胞都能得到處理、可以適用高質(zhì)量試劑進行可靠的NGS樣品制備、可以降低批次效應(yīng)影響,提升可重復性。ICELL8單細胞分選系統(tǒng)可以滿足以上需求。
ICELL8系統(tǒng)專注于單細胞的分離和分選,并搭配有高質(zhì)量NGS試劑盒。基于泊松分布原理,ICELL8系統(tǒng)將細胞樣品懸液分注到微孔芯片中,并通過熒光顯微成像將捕獲到單細胞的微孔挑選出來。液體分注器孔徑達125 μm,可以快速地完成最多8種單細胞樣品的處理,并將建庫試劑選擇性地加入特定微孔中。一張芯片可獲得1,200~1,700個單細胞。芯片上所有微孔可以通過Hoechst、PI熒光通道進行圖像檢測,確認細胞活性等狀態(tài)。通過海報內(nèi)容對使用ICELL8系統(tǒng)完成的單細胞全長轉(zhuǎn)錄分析進行了靈敏性與可重復性展示。
 
利用SMART-Seq方法在ICELL8 cx Single-Cell System上進行可靠、靈敏的單細胞高通量融合基因檢測
Robust and sensitive detection of gene fusions using high-throughput SMART-Seq chemistry on the ICELL8 cx system
 
內(nèi)容簡介:
高通量地分選細胞并獲得單細胞全長轉(zhuǎn)錄本信息,對于需要豐富單細胞數(shù)據(jù)的科研團隊來說越來越重要。通過ICELL8 cx Single-Cell System運行的自動化SMART-Seq流程可以滿足對單細胞全長轉(zhuǎn)錄本信息的需求,該方法能夠提供更多轉(zhuǎn)錄本末端捕獲方法無法提供的重要信息。
海報內(nèi)容展示了通過自動化SMART-Seq工作流程捕獲融合基因連接reads(Junction reads)和跨越reads(spanning reads)的情況。通過這種自動化的全長mRNA-seq方法可以對乳腺癌細胞中的基因融合事件進行可靠的鑒定。
 
利用開放性設(shè)計的ICELL8 cx Single-Cell System進行定制化單細胞NGS方案開發(fā)
Development of custom single-cell assay protocols using the ICELL8 cx system and open architecture
 
內(nèi)容簡介:
在臨床研究以及各類應(yīng)用領(lǐng)域中使用二代測序技術(shù)時,要求能夠同時對大量樣品進行準確處理,并且有配套試劑能夠可靠地完成文庫制備。關(guān)于單細胞以及核酸相關(guān)的研究發(fā)展迅速,其中一個挑戰(zhàn)性問題就是找到一個能夠支持研究領(lǐng)域動態(tài)變化需求的儀器平臺。
海報內(nèi)容將向您展示利用ICELL8技術(shù)、成像功能及CELLSTUDIO軟件成功開發(fā)的多種單細胞分析流程案例。
 
SMART-Seq Pro 新一代單細胞全長轉(zhuǎn)錄組分析
Development of a complete, end-to-end, automated single-cell system for biomarker discovery
 
內(nèi)容簡介:
全長序列覆蓋可以實現(xiàn)對整個轉(zhuǎn)錄組的差異表達分析,并且可以對基因融合、剪接體這類生物標志物進行檢測。經(jīng)深度優(yōu)化推出的SMART-Seq Pro Application Kit(舊版本:SMART-Seq Application Kit),具備良好的單細胞全長mRNA分析能力,在ICELL8 cx單細胞平臺上一張微孔芯片可同時完成1,200~1,500個單細胞 (核)文庫構(gòu)建,并整合了生物信息學工具,為“藏珠于?!钡霓D(zhuǎn)錄水平稀有生物標志物發(fā)掘提供了有力工具。
海報內(nèi)容比較了SMART-Seq Pro與實驗室自制方法SMART-seq2(SS2)的檢測敏感性差異,發(fā)現(xiàn)SMART Seq Pro試劑盒檢測到的基因數(shù)量明顯比SS2多,同時SSPro還能夠正確識別PTPRC基因的臨床相關(guān)剪接體,突出了SSPro具有揭示罕見生物事件的能力。此外,SSPro還成功識別了被3'末端分析所遺漏的PTPRC亞型。以上實驗數(shù)據(jù)說明SSPro能夠識別臨床相關(guān)異構(gòu)體,同時結(jié)合Cogent NGS生信分析工具,提供對單細胞樣本中重要生物標志物的高靈敏檢測方案。
 

頁面更新:2023-03-03 14:52:39