與疫情賽跑,一步法RT-qPCR快速篩查新冠病毒 |
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多人死亡,往返中國的航班取消,潛在接觸者被隔離,促使世界衛(wèi)生組織(WHO)宣布新型冠狀病毒(2019-nCoV)疫情被劃入“國際關(guān)注的突發(fā)公共衛(wèi)生事件”(PHEIC)。截至2020年2月10日,2019-nCoV引發(fā)的呼吸道疾病已導(dǎo)致全球1000余人死亡,4萬余人確診患病。
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冠狀病毒是一類能引起上呼吸道和下呼吸道疾病的病毒,具有類似太陽冠冕的特征性尖刺外觀。許多常見的冠狀病毒通常會導(dǎo)致輕度到中度的癥狀,但有些病毒會導(dǎo)致嚴(yán)重的癥狀,并可能發(fā)展為致命的肺炎,比如在2003年爆發(fā)的SARS-CoV 和2015年的MERS-CoV。由于2019-nCoV引發(fā)的肺炎導(dǎo)致多人死亡,且可能潛在的無癥狀個體傳播,因此,對該病毒進行有效的實驗室篩查對控制此次疫情至關(guān)重要。 |
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2020年1月24日,中國疾病預(yù)防控制中心等權(quán)威機構(gòu)發(fā)布了鑒定2019-nCoV的文獻(xiàn)《A Novel Coronavirus from Patients with Pneumonia in China, 2019》。文章中,作者開發(fā)了一種病毒篩選方法,通過RNA-Seq技術(shù)獲得了特異性病毒序列,對2019-nCoV進行測序和分類,還使用光鏡和透射電鏡觀察了2019-nCoV感染的人呼吸道上皮細(xì)胞中培養(yǎng)物的病毒顆粒和細(xì)胞病變效應(yīng)。這其中使用了Takara探針法One Step PrimeScript™ RT-PCR Kit (Perfect Real Time)(Code No. RR064)。 |
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中國科學(xué)院武漢病毒研究所發(fā)表的文章《Discovery of a novel coronavirus associated with the recent pneumonia outbreak in humans and its potential bat origin》,已經(jīng)鑒定出該病毒在整個基因組水平上與蝙蝠冠狀病毒96%相同,對7種保守的非結(jié)構(gòu)蛋白的成對序列分析表明,該病毒屬于SARSr-CoV。重要的是,他們證實2019-nCoV使用了與SARS冠狀病毒相同的細(xì)胞進入受體ACE2。該團隊使用了Takara的SMARTer RACE 5'/3' Kit(Code No. 634858) 用于確定病毒基因組的5'末端序列。 |
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另一個研究小組(Letko和Munster 2020)利用Takara高效率無縫克隆技術(shù)In-Fusion HD Cloning Kit(Code No. 639648)克隆了該病毒的刺突編碼序列,研究了2019-nCoV的細(xì)胞進入機制。 |
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類似的方法已經(jīng)被許多組織用來識別這種特殊病毒的其他部分。中國疾病預(yù)防控制中心推薦了One Step PrimeScript™ RT-PCR Kit (Perfect Real Time)(Code No. RR064)用于2019-nCoV的檢測,并已經(jīng)在中國各地被廣泛使用。世界衛(wèi)生組織(WHO)和疾病預(yù)防控制中心(CDC)已經(jīng)開發(fā)出類似的方法,隨著更多病例的報道,WHO將對病毒檢測方法提出更多建議。 |
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我們正迅速行動,以滿足中國以及其他國家不斷增加的2019-nCoV篩查需求。
Takara 愿以高質(zhì)量的產(chǎn)品和熱忱的服務(wù),為2019-nCoV篩查貢獻(xiàn)綿薄之力。 |
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山川異域,風(fēng)月同天。守望相助,眾志成城。 |
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Takara提供2019-nCoV篩查完整解決方案 |
產(chǎn)品 |
Code No. |
包裝量 |
用途 |
DNA-OFF® |
9036 |
500 ml |
去除實驗區(qū)域DNA污染 |
RNase-OFF® |
9037 |
500 ml |
去除RNase污染 |
TaKaRa MiniBEST Viral RNA/DNA Extraction Kit Ver.5.0 |
9766 |
50 次 |
柱式法病毒核酸提取 |
RNAiso Plus |
9108/9109 |
100/200 ml |
試劑型Total RNA提取 |
One Step PrimeScript™ RT-PCR Kit (Perfect Real Time) |
RR064A/B |
100/500 次 (50 μl反應(yīng)) |
probe法One Step RT-qPCR |
PrimeDirect® Probe RT-qPCR Mix |
RR650A/B |
200/1,000 次(25 μl反應(yīng)) |
無需RNA純化,直接進行probe法One Step RT-qPCR |
PrimeDirect® Probe RT-qPCR Mix, with UNG |
RR651A/B |
200/1,000 次(25 μl反應(yīng)) |
RR650的UNG版本,防止假陽性 |
One Step PrimeScript™ III RT-qPCR Mix |
RR600A/B |
200/1,000 次(25 μl反應(yīng)) |
完全premix型probe法One Step RT-qPCR |
One Step PrimeScript™ III RT-qPCR Mix, with UNG |
RR601A/B |
200/1,000 次(25 μl反應(yīng)) |
RR600的UNG版本,防止假陽性 |
Uracil DNA Glycosylase (UNG), heat-labile |
2820 |
200 U |
防止Carryover污染導(dǎo)致的假陽性 |
dU plus dNTP Mixture (12.5×) |
4035 |
800 μl |
防止Carryover污染導(dǎo)致的假陽性 |
dNTP Mixture |
4030 |
各3.2 μmol/1.28 ml |
PCR底物 |
dNTP Mixture |
4019 |
各2.5 μmol/250 μl |
PCR底物 |
Reverse Transcriptase M-MLV (RNase H-) |
2641A/B |
10,000/40,000 U |
反轉(zhuǎn)錄酶 |
Recombinant RNase Inhibitor |
2313A/B |
5,000/25,000 U |
RNase抑制劑 |
T7 RNA Polymerase |
2540A/B |
5,000 U/25,000 U |
RNA標(biāo)準(zhǔn)品的體外轉(zhuǎn)錄 |
RNase-free Water |
9012 |
1 ml×10 支 |
RNA實驗用水 |
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除上述目錄產(chǎn)品外,Takara不斷完善病毒檢測方案,提供WHO、中國疾病預(yù)防控制中心公布指導(dǎo)的引物探針套裝、美國疾病控制與預(yù)防中心公布指導(dǎo)的引物探針套裝。
同時,引物探針套裝中還增加了所有檢測靶點Control RNA產(chǎn)品。 |
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一、新型冠狀病毒(2019-nCoV)ORF1ab基因、E蛋白基因、N蛋白基因檢測套裝: |
序號 |
Primer/Probe名稱* |
堿基序列 (方向為5' to 3')* |
5'修飾 |
3'修飾 |
Control RNA** |
01 |
2019-nCoV RdRP_SARSr-F2 |
GTG ARA TGG TCA TGT GTG GCG G |
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Ger-RdRP |
02 |
2019-nCoV RdRP_SARSr-R1 |
CAR ATG TTA AAS ACA CTA TTA GCA TA |
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03 |
2019-nCoV RdRP_SARSr-P2 |
CAG GTG GAA CCT CAT CAG GAG ATG C |
FAM |
BHQ-1 |
04 |
2019-nCoV RdRP_SARSr-P1 |
CCA GGT GGW ACR TCA TCM GGT GAT GC |
FAM |
BHQ-1 |
05 |
2019-nCoV E_Sardeco-F1 |
ACA GGT ACG TTA ATA GTT AAT AGC GT |
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Ger-E |
06 |
2019-nCoV E_Sardeco-R2 |
ATA TTG CAG CAG TAC GCA CAC A |
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07 |
2019-nCoV E_Sardeco-P1 |
ACA CTA GCC ATC CTT ACT GCG CTT CG |
FAM |
BHQ-1 |
08 |
2019-nCoV N_Sarbeco_F1 |
CAC ATT GGC ACC CGC AAT C |
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Ger-N |
09 |
2019-nCoV N_Sarbeco_R1 |
GAG GAA CGA GAA GAG GCT TG |
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10 |
2019-nCoV N_Sarbeco_P1 |
ACT TCC TCA AGG AAC AAC ATT GCC A |
FAM |
BHQ-1 |
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二、新型冠狀病毒(2019-nCoV)ORF1ab/N基因檢測套裝: |
序號 |
Primer/Probe名稱* |
堿基序列 (方向為5' to 3')* |
5'修飾 |
3'修飾 |
Control RNA** |
11 |
2019-nCoV nsp14F |
TGG GGY TTT ACR GGT AAC CT |
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HK-ab1 |
12 |
2019-nCoV nsp14R |
AAC RCG CTT AAC AAA GCA CTC |
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13 |
2019-nCoV nsp14P |
TAG TTG TGA TGC WAT CAT GAC TAG |
FAM |
TAMRA |
14 |
2019-nCoV NF |
TAA TCA GAC AAG GAA CTG ATT A |
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HK-N |
15 |
2019-nCoV NR |
CGA AGG TGT GAC TTC CAT G |
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16 |
2019-nCoV NP |
GCA AAT TGT GCA ATT TGC GG |
FAM |
TAMRA |
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根據(jù)中國疾病預(yù)防控制中心病毒病預(yù)防控制所公布指導(dǎo),Takara提供一個qPCR引物探針套裝: |
序號 |
Primer/Probe名稱* |
堿基序列 (方向為5' to 3')* |
5'修飾 |
3'修飾 |
Control RNA** |
17 |
CDC 2019-nCoV ORF1ab-F |
CCCTGTGGGTTTTACACTTAA |
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CDC-ORF1ab |
18 |
CDC 2019-nCoV ORF1ab-R |
ACGATTGTGCATCAGCTGA |
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19 |
CDC 2019-nCoV ORF1ab-P |
CCGTCTGCGGTATGTGGAAAGGTTATGG |
FAM |
BHQ-1 |
20 |
CDC 2019-nCoV N-F |
GGGGAACTTCTCCTGCTAGAAT |
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CDC-N |
21 |
CDC 2019-nCoV N-R |
CAGACATTTTGCTCTCAAGCTG |
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22 |
CDC 2019-nCoV N-P |
TTGCTGCTGCTTGACAGATT |
FAM |
TAMRA |
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根據(jù)美國疾病控制與預(yù)防中心公布指導(dǎo),Takara提供一個qPCR引物探針套裝: |
序號 |
Primer/Probe名稱* |
堿基序列 (方向為5' to 3')* |
5'修飾 |
3'修飾 |
Control RNA** |
23 |
US CDC 2019-nCoV_N1-F |
GACCCCAAAATCAGCGAAAT |
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US-N1 |
24 |
US CDC 2019-nCoV_N1-R |
TCTGGTTACTGCCAGTTGAATCTG |
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25 |
US CDC 2019-nCoV_N1-P |
ACCCCGCATTACGTTTGGTGGACC |
FAM |
BHQ-1 |
26 |
US CDC 2019-nCoV_N2-F |
TTACAAACATTGGCCGCAAA |
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US-N2 |
27 |
US CDC 2019-nCoV_N2-R |
GCGCGACATTCCGAAGAA |
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28 |
US CDC 2019-nCoV_N2-P |
ACAATTTGCCCCCAGCGCTTCAG |
FAM |
BHQ-1 |
29 |
US CDC 2019-nCoV_N3-F |
GGGAGCCTTGAATACACCAAAA |
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US-N3 |
30 |
US CDC 2019-nCoV_N3-R |
TGTAGCACGATTGCAGCATTG |
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31 |
US CDC 2019-nCoV_N3-P |
AYCACATTGGCACCCGCAATCCTG |
FAM |
BHQ-1 |
32 |
US CDC RP-F(內(nèi)參檢測用) |
AGATTTGGACCTGCGAGCG |
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33 |
US CDC RP-R(內(nèi)參檢測用) |
GAGCGGCTGTCTCCACAAGT |
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34 |
US CDC RP-P(內(nèi)參檢測用) |
TTCTGACCTGAAGGCTCTGCGCG |
FAM |
BHQ-1 |
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*所有引物探針為HPLC純化級別,客戶可以根據(jù)需要選擇合適的套裝。 |
**Control RNA產(chǎn)品需單獨訂購,訂購時請咨詢各地代理商。 |
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Takara還可以提供使用簡便、性價比高、可靠的Real Time PCR儀Thermal Cycler Dice Real Time System III (Code No. TP950)。 除具有以往Takara PCR儀受到好評的友好操作軟件外,還搭載觸摸屏控制面板,可進行單機 (獨立) 操作,以追求操作簡便性。 |
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特點介紹: |
◇ 搭載觸摸屏,可獨立操作,支持英語/日語界面,儀器軟件更加追求操作簡便性。
◇ 可做高速定量PCR反應(yīng)。
使用嵌合熒光染料檢測法時,與試劑TB Green Fast qPCR Mix(Code No. RR430)搭配使用,TP950可完成快速定量PCR反應(yīng)。
◇ 專為科研用戶設(shè)計的便于操作的定量軟件。 |
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