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當前位置:首頁> 產品選擇指南 > 自動化系統(tǒng) > 高通量單細胞分選系統(tǒng)ICELL8 cx 及其應用 > 自動化高通量的單細胞全長轉錄組分析(SMART-Seq Pro)
自動化高通量的單細胞全長轉錄組分析(SMART-Seq Pro)
品牌 Code No. 產品名稱 包裝量 價格(元) 說明書 數(shù)量
Clontech 640257 SMART-Seq Pro Application Kit 2 Chips 詢價
Clontech 640192 ICELL8® 384-Well Source Plate and Seal Each 詢價
Clontech 640018 MSND 384-Well Source Plate and Seal 20/Pack 詢價
無標題文檔
 
全長轉錄組分析 延伸 單細胞全長cDNA制備 NGS文庫制備 NGS文庫定量
 
  NGS文庫制備系統(tǒng)
 
SMART-Seq技術助力ICELL8 cx系統(tǒng)單細胞全長轉錄組分析方案
 
全長序列覆蓋可以實現(xiàn)對整個轉錄的差異表達分析,并且可以對基因融合、剪接體這類生物標志物進行檢測。高靈敏度的SMART-Seq Pro可以勝任以上分析需求。
SMART-Seq Pro Application Kit將SMART-Seq試劑與ICELL8 cx Single-Cell System(Cat No. 640188)相結合,并整合了生物信息學工具,提供一套端到端的單細胞全長轉錄組分析流程,一次實驗可以對1,200~1,500個分離的單細胞進行高效的全長轉錄組分析。
通過ICELL8 cx系統(tǒng)將細胞分注到ICELL8 350v Chip(Cat No. 640019)空白微孔芯片中。使用ICELL8 cx CellSelect Software鑒定出含單個細胞的微孔,文庫構建試劑只被分注到這些選中的微孔中。經(jīng)過一系列分注和擴增步驟后,獲得無偏倚的全長cDNA,并通過Illumina Bead-Linked Transposome(BLT)完成酶切片段化。在這一擴展性的工作流程中,cDNA擴增階段引入了Illumina特異性接頭序列,生成的文庫已連接index接頭,可直接用于Illumina測序平臺。測序過程結束后,獲得的測序數(shù)據(jù)可直接導入Cogent NGS軟件工具進行生物信息學分析,解釋測序結果。
 
NOTE:舊版本SMART-Seq Application Kit(Cat No. 640222)依然可以購買。
 
更多孔板測序應用,請參見 單細胞RNA-Seq / DNA-Seq
 
■ 概述
· 端到端的解決方案:從文庫制備到測序數(shù)據(jù)分析工具
· 覆蓋全長mRNA:捕獲轉錄組中“深藏”的關鍵生物標志物,如基因融合、剪接異構體
· 高通量單細胞分析:可以平行地從>1,000個單細胞中生成測序數(shù)據(jù)
· 樣品配置靈活:一次實驗最多可對八種細胞樣品進行分析
· 減少樣品操作:減小數(shù)據(jù)波動,構建測序文庫前自動鑒定并分選出感興趣的細胞,僅對這些細胞進行試劑分注
· Illumina平臺測序文庫:制備的測序文庫適用于Illumina全系平臺
 
■應用
用于Illumina平臺上高通量全長單細胞轉錄組測序文庫制備
圖1. SMART-Seq Pro和Smart-seq2在PBMCs中基因檢測結果比較
 
 
Technote:
點擊圖片查看
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頁面更新:2024-11-04 09:01:09

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